Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
APEX2Q9UBZ4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APEX2Q9UBZ4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
APEX2Q9UBZ4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
APEX2Q9UBZ4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
APEX2Q9UBZ4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
APEX2Q9UBZ4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
APEX2Q9UBZ4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
APEX2Q9UBZ4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APEX2Q9UBZ4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
APEX2Q9UBZ4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APEX2Q9UBZ4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
APEX2Q9UBZ4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
APEX2Q9UBZ4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
APEX2Q9UBZ4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
APEX2Q9UBZ4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
APEX2Q9UBZ4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
APEX2Q9UBZ4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
APEX2Q9UBZ4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
APEX2Q9UBZ4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APEX2Q9UBZ4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
APEX2Q9UBZ4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
APEX2Q9UBZ4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APEX2Q9UBZ4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APEX2Q9UBZ4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
APEX2Q9UBZ4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
APEX2Q9UBZ4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APEX2Q9UBZ4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
APEX2Q9UBZ4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APEX2Q9UBZ4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APEX2Q9UBZ4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APEX2Q9UBZ4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APEX2Q9UBZ4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
APEX2Q9UBZ4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
APEX2Q9UBZ4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APEX2Q9UBZ4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APEX2Q9UBZ4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APEX2Q9UBZ4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APEX2Q9UBZ4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
APEX2Q9UBZ4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
APEX2Q9UBZ4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
APEX2Q9UBZ4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
APEX2Q9UBZ4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
APEX2Q9UBZ4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APEX2Q9UBZ4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APEX2Q9UBZ4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APEX2Q9UBZ4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APEX2Q9UBZ4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
APEX2Q9UBZ4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
APEX2Q9UBZ4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
APEX2Q9UBZ4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
APEX2Q9UBZ4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
APEX2Q9UBZ4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APEX2Q9UBZ4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
APEX2Q9UBZ4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APEX2Q9UBZ4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
APEX2Q9UBZ4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APEX2Q9UBZ4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APEX2Q9UBZ4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APEX2Q9UBZ4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
APEX2Q9UBZ4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
APEX2Q9UBZ4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
APEX2Q9UBZ4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
APEX2Q9UBZ4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
APEX2Q9UBZ4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
APEX2Q9UBZ4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APEX2Q9UBZ4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APEX2Q9UBZ4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
APEX2Q9UBZ4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APEX2Q9UBZ4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APEX2Q9UBZ4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
APEX2Q9UBZ4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
APEX2Q9UBZ4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
APEX2Q9UBZ4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
APEX2Q9UBZ4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
APEX2Q9UBZ4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
APEX2Q9UBZ4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
APEX2Q9UBZ4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
APEX2Q9UBZ4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
APEX2Q9UBZ4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
APEX2Q9UBZ4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
APEX2Q9UBZ4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
APEX2Q9UBZ4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
APEX2Q9UBZ4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
APEX2Q9UBZ4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
APEX2Q9UBZ4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
APEX2Q9UBZ4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
APEX2Q9UBZ4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
APEX2Q9UBZ4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
APEX2Q9UBZ4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
APEX2Q9UBZ4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
APEX2Q9UBZ4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
APEX2Q9UBZ4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
APEX2Q9UBZ4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
APEX2Q9UBZ4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
APEX2Q9UBZ4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APEX2Q9UBZ4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
APEX2Q9UBZ4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
APEX2Q9UBZ4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
APEX2Q9UBZ4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms