Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CHD7Q9P2D1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CHD7Q9P2D1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHD7Q9P2D1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHD7Q9P2D1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHD7Q9P2D1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHD7Q9P2D1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHD7Q9P2D1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHD7Q9P2D1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHD7Q9P2D1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHD7Q9P2D1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CHD7Q9P2D1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHD7Q9P2D1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHD7Q9P2D1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHD7Q9P2D1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CHD7Q9P2D1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHD7Q9P2D1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHD7Q9P2D1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHD7Q9P2D1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHD7Q9P2D1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHD7Q9P2D1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHD7Q9P2D1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHD7Q9P2D1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHD7Q9P2D1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHD7Q9P2D1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHD7Q9P2D1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHD7Q9P2D1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CHD7Q9P2D1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHD7Q9P2D1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHD7Q9P2D1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHD7Q9P2D1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHD7Q9P2D1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHD7Q9P2D1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHD7Q9P2D1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHD7Q9P2D1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHD7Q9P2D1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHD7Q9P2D1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHD7Q9P2D1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHD7Q9P2D1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHD7Q9P2D1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHD7Q9P2D1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHD7Q9P2D1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CHD7Q9P2D1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CHD7Q9P2D1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHD7Q9P2D1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHD7Q9P2D1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHD7Q9P2D1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHD7Q9P2D1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHD7Q9P2D1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHD7Q9P2D1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CHD7Q9P2D1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHD7Q9P2D1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHD7Q9P2D1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CHD7Q9P2D1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CHD7Q9P2D1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHD7Q9P2D1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHD7Q9P2D1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHD7Q9P2D1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHD7Q9P2D1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHD7Q9P2D1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHD7Q9P2D1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHD7Q9P2D1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHD7Q9P2D1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHD7Q9P2D1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHD7Q9P2D1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHD7Q9P2D1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHD7Q9P2D1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHD7Q9P2D1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHD7Q9P2D1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHD7Q9P2D1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHD7Q9P2D1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHD7Q9P2D1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHD7Q9P2D1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHD7Q9P2D1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHD7Q9P2D1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHD7Q9P2D1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHD7Q9P2D1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHD7Q9P2D1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHD7Q9P2D1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHD7Q9P2D1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHD7Q9P2D1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHD7Q9P2D1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CHD7Q9P2D1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHD7Q9P2D1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHD7Q9P2D1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHD7Q9P2D1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHD7Q9P2D1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHD7Q9P2D1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHD7Q9P2D1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHD7Q9P2D1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHD7Q9P2D1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHD7Q9P2D1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHD7Q9P2D1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHD7Q9P2D1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHD7Q9P2D1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHD7Q9P2D1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHD7Q9P2D1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHD7Q9P2D1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CHD7Q9P2D1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHD7Q9P2D1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms