Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1W8

SIRPG, Signal-regulatory protein gamma, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRPGQ9P1W8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIRPGQ9P1W8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIRPGQ9P1W8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIRPGQ9P1W8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIRPGQ9P1W8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIRPGQ9P1W8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIRPGQ9P1W8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIRPGQ9P1W8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIRPGQ9P1W8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SIRPGQ9P1W8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIRPGQ9P1W8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIRPGQ9P1W8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIRPGQ9P1W8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIRPGQ9P1W8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIRPGQ9P1W8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIRPGQ9P1W8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SIRPGQ9P1W8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SIRPGQ9P1W8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SIRPGQ9P1W8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SIRPGQ9P1W8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIRPGQ9P1W8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIRPGQ9P1W8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIRPGQ9P1W8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIRPGQ9P1W8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIRPGQ9P1W8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIRPGQ9P1W8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIRPGQ9P1W8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIRPGQ9P1W8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIRPGQ9P1W8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIRPGQ9P1W8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIRPGQ9P1W8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIRPGQ9P1W8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIRPGQ9P1W8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIRPGQ9P1W8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIRPGQ9P1W8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIRPGQ9P1W8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIRPGQ9P1W8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIRPGQ9P1W8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIRPGQ9P1W8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIRPGQ9P1W8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SIRPGQ9P1W8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIRPGQ9P1W8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIRPGQ9P1W8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIRPGQ9P1W8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIRPGQ9P1W8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIRPGQ9P1W8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIRPGQ9P1W8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIRPGQ9P1W8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIRPGQ9P1W8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIRPGQ9P1W8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIRPGQ9P1W8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SIRPGQ9P1W8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SIRPGQ9P1W8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIRPGQ9P1W8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIRPGQ9P1W8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIRPGQ9P1W8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIRPGQ9P1W8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIRPGQ9P1W8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SIRPGQ9P1W8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIRPGQ9P1W8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SIRPGQ9P1W8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIRPGQ9P1W8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIRPGQ9P1W8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIRPGQ9P1W8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIRPGQ9P1W8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIRPGQ9P1W8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIRPGQ9P1W8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIRPGQ9P1W8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIRPGQ9P1W8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIRPGQ9P1W8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SIRPGQ9P1W8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIRPGQ9P1W8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIRPGQ9P1W8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIRPGQ9P1W8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIRPGQ9P1W8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIRPGQ9P1W8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIRPGQ9P1W8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIRPGQ9P1W8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIRPGQ9P1W8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIRPGQ9P1W8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIRPGQ9P1W8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIRPGQ9P1W8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIRPGQ9P1W8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIRPGQ9P1W8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIRPGQ9P1W8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIRPGQ9P1W8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SIRPGQ9P1W8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIRPGQ9P1W8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIRPGQ9P1W8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIRPGQ9P1W8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIRPGQ9P1W8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIRPGQ9P1W8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIRPGQ9P1W8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIRPGQ9P1W8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIRPGQ9P1W8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIRPGQ9P1W8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIRPGQ9P1W8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIRPGQ9P1W8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIRPGQ9P1W8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIRPGQ9P1W8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms