Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNAJC17Q9NVM6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNAJC17Q9NVM6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNAJC17Q9NVM6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNAJC17Q9NVM6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNAJC17Q9NVM6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNAJC17Q9NVM6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
DNAJC17Q9NVM6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNAJC17Q9NVM6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
DNAJC17Q9NVM6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNAJC17Q9NVM6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNAJC17Q9NVM6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNAJC17Q9NVM6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNAJC17Q9NVM6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
DNAJC17Q9NVM6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNAJC17Q9NVM6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNAJC17Q9NVM6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNAJC17Q9NVM6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNAJC17Q9NVM6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNAJC17Q9NVM6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNAJC17Q9NVM6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNAJC17Q9NVM6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNAJC17Q9NVM6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNAJC17Q9NVM6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNAJC17Q9NVM6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNAJC17Q9NVM6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DNAJC17Q9NVM6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DNAJC17Q9NVM6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
DNAJC17Q9NVM6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DNAJC17Q9NVM6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DNAJC17Q9NVM6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DNAJC17Q9NVM6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DNAJC17Q9NVM6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DNAJC17Q9NVM6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DNAJC17Q9NVM6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DNAJC17Q9NVM6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DNAJC17Q9NVM6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNAJC17Q9NVM6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNAJC17Q9NVM6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNAJC17Q9NVM6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNAJC17Q9NVM6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNAJC17Q9NVM6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNAJC17Q9NVM6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNAJC17Q9NVM6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNAJC17Q9NVM6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNAJC17Q9NVM6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNAJC17Q9NVM6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNAJC17Q9NVM6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNAJC17Q9NVM6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNAJC17Q9NVM6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNAJC17Q9NVM6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNAJC17Q9NVM6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNAJC17Q9NVM6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNAJC17Q9NVM6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNAJC17Q9NVM6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNAJC17Q9NVM6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNAJC17Q9NVM6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNAJC17Q9NVM6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNAJC17Q9NVM6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
DNAJC17Q9NVM6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNAJC17Q9NVM6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNAJC17Q9NVM6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNAJC17Q9NVM6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
DNAJC17Q9NVM6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNAJC17Q9NVM6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
DNAJC17Q9NVM6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNAJC17Q9NVM6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNAJC17Q9NVM6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNAJC17Q9NVM6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNAJC17Q9NVM6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNAJC17Q9NVM6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNAJC17Q9NVM6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNAJC17Q9NVM6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
DNAJC17Q9NVM6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNAJC17Q9NVM6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNAJC17Q9NVM6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNAJC17Q9NVM6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNAJC17Q9NVM6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNAJC17Q9NVM6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNAJC17Q9NVM6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNAJC17Q9NVM6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNAJC17Q9NVM6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNAJC17Q9NVM6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNAJC17Q9NVM6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNAJC17Q9NVM6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNAJC17Q9NVM6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNAJC17Q9NVM6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNAJC17Q9NVM6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNAJC17Q9NVM6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNAJC17Q9NVM6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNAJC17Q9NVM6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNAJC17Q9NVM6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
DNAJC17Q9NVM6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNAJC17Q9NVM6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNAJC17Q9NVM6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
DNAJC17Q9NVM6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNAJC17Q9NVM6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNAJC17Q9NVM6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNAJC17Q9NVM6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNAJC17Q9NVM6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms