Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUP7

TRMT13, tRNA:m(4)X modification enzyme TRM13 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT13Q9NUP7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRMT13Q9NUP7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRMT13Q9NUP7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TRMT13Q9NUP7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRMT13Q9NUP7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRMT13Q9NUP7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRMT13Q9NUP7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRMT13Q9NUP7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRMT13Q9NUP7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TRMT13Q9NUP7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TRMT13Q9NUP7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRMT13Q9NUP7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRMT13Q9NUP7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRMT13Q9NUP7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRMT13Q9NUP7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRMT13Q9NUP7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRMT13Q9NUP7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRMT13Q9NUP7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRMT13Q9NUP7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRMT13Q9NUP7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRMT13Q9NUP7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRMT13Q9NUP7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRMT13Q9NUP7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRMT13Q9NUP7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRMT13Q9NUP7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TRMT13Q9NUP7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRMT13Q9NUP7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRMT13Q9NUP7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRMT13Q9NUP7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRMT13Q9NUP7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRMT13Q9NUP7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRMT13Q9NUP7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRMT13Q9NUP7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRMT13Q9NUP7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRMT13Q9NUP7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRMT13Q9NUP7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRMT13Q9NUP7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRMT13Q9NUP7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRMT13Q9NUP7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRMT13Q9NUP7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRMT13Q9NUP7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRMT13Q9NUP7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRMT13Q9NUP7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TRMT13Q9NUP7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRMT13Q9NUP7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRMT13Q9NUP7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRMT13Q9NUP7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRMT13Q9NUP7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRMT13Q9NUP7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRMT13Q9NUP7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRMT13Q9NUP7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRMT13Q9NUP7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRMT13Q9NUP7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRMT13Q9NUP7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRMT13Q9NUP7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRMT13Q9NUP7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRMT13Q9NUP7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRMT13Q9NUP7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRMT13Q9NUP7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRMT13Q9NUP7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRMT13Q9NUP7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRMT13Q9NUP7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRMT13Q9NUP7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRMT13Q9NUP7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRMT13Q9NUP7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRMT13Q9NUP7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRMT13Q9NUP7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TRMT13Q9NUP7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRMT13Q9NUP7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRMT13Q9NUP7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRMT13Q9NUP7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRMT13Q9NUP7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRMT13Q9NUP7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRMT13Q9NUP7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRMT13Q9NUP7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRMT13Q9NUP7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRMT13Q9NUP7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRMT13Q9NUP7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRMT13Q9NUP7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRMT13Q9NUP7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRMT13Q9NUP7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRMT13Q9NUP7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TRMT13Q9NUP7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRMT13Q9NUP7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TRMT13Q9NUP7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRMT13Q9NUP7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRMT13Q9NUP7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRMT13Q9NUP7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRMT13Q9NUP7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRMT13Q9NUP7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRMT13Q9NUP7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRMT13Q9NUP7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRMT13Q9NUP7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRMT13Q9NUP7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRMT13Q9NUP7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRMT13Q9NUP7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRMT13Q9NUP7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRMT13Q9NUP7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRMT13Q9NUP7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRMT13Q9NUP7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms