Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GPHNQ9NQX3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GPHNQ9NQX3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GPHNQ9NQX3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GPHNQ9NQX3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
GPHNQ9NQX3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GPHNQ9NQX3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GPHNQ9NQX3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GPHNQ9NQX3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GPHNQ9NQX3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GPHNQ9NQX3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GPHNQ9NQX3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GPHNQ9NQX3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GPHNQ9NQX3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GPHNQ9NQX3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
GPHNQ9NQX3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GPHNQ9NQX3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GPHNQ9NQX3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GPHNQ9NQX3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GPHNQ9NQX3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GPHNQ9NQX3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GPHNQ9NQX3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GPHNQ9NQX3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GPHNQ9NQX3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GPHNQ9NQX3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GPHNQ9NQX3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GPHNQ9NQX3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
GPHNQ9NQX3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GPHNQ9NQX3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GPHNQ9NQX3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GPHNQ9NQX3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GPHNQ9NQX3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GPHNQ9NQX3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GPHNQ9NQX3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GPHNQ9NQX3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GPHNQ9NQX3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GPHNQ9NQX3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GPHNQ9NQX3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GPHNQ9NQX3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GPHNQ9NQX3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GPHNQ9NQX3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
GPHNQ9NQX3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GPHNQ9NQX3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GPHNQ9NQX3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GPHNQ9NQX3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GPHNQ9NQX3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GPHNQ9NQX3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GPHNQ9NQX3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GPHNQ9NQX3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GPHNQ9NQX3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GPHNQ9NQX3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GPHNQ9NQX3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GPHNQ9NQX3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GPHNQ9NQX3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GPHNQ9NQX3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
GPHNQ9NQX3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GPHNQ9NQX3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GPHNQ9NQX3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GPHNQ9NQX3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GPHNQ9NQX3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GPHNQ9NQX3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GPHNQ9NQX3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GPHNQ9NQX3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GPHNQ9NQX3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GPHNQ9NQX3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GPHNQ9NQX3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GPHNQ9NQX3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GPHNQ9NQX3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GPHNQ9NQX3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GPHNQ9NQX3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GPHNQ9NQX3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GPHNQ9NQX3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
GPHNQ9NQX3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
GPHNQ9NQX3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GPHNQ9NQX3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GPHNQ9NQX3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GPHNQ9NQX3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GPHNQ9NQX3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GPHNQ9NQX3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GPHNQ9NQX3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GPHNQ9NQX3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GPHNQ9NQX3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
GPHNQ9NQX3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GPHNQ9NQX3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GPHNQ9NQX3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GPHNQ9NQX3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GPHNQ9NQX3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GPHNQ9NQX3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GPHNQ9NQX3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GPHNQ9NQX3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GPHNQ9NQX3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GPHNQ9NQX3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GPHNQ9NQX3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
GPHNQ9NQX3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GPHNQ9NQX3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GPHNQ9NQX3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GPHNQ9NQX3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GPHNQ9NQX3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
GPHNQ9NQX3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GPHNQ9NQX3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms