Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV7

PRDM9, Histone-lysine N-methyltransferase PRDM9, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM9Q9NQV7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM9Q9NQV7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM9Q9NQV7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDM9Q9NQV7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDM9Q9NQV7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDM9Q9NQV7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDM9Q9NQV7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDM9Q9NQV7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDM9Q9NQV7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDM9Q9NQV7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDM9Q9NQV7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDM9Q9NQV7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDM9Q9NQV7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDM9Q9NQV7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDM9Q9NQV7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDM9Q9NQV7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDM9Q9NQV7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDM9Q9NQV7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDM9Q9NQV7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDM9Q9NQV7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDM9Q9NQV7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDM9Q9NQV7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDM9Q9NQV7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDM9Q9NQV7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDM9Q9NQV7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDM9Q9NQV7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDM9Q9NQV7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDM9Q9NQV7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDM9Q9NQV7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDM9Q9NQV7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDM9Q9NQV7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDM9Q9NQV7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDM9Q9NQV7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDM9Q9NQV7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDM9Q9NQV7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDM9Q9NQV7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDM9Q9NQV7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDM9Q9NQV7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDM9Q9NQV7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDM9Q9NQV7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM9Q9NQV7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM9Q9NQV7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM9Q9NQV7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM9Q9NQV7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM9Q9NQV7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM9Q9NQV7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRDM9Q9NQV7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRDM9Q9NQV7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRDM9Q9NQV7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRDM9Q9NQV7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRDM9Q9NQV7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRDM9Q9NQV7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRDM9Q9NQV7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRDM9Q9NQV7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRDM9Q9NQV7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRDM9Q9NQV7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRDM9Q9NQV7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRDM9Q9NQV7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRDM9Q9NQV7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRDM9Q9NQV7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRDM9Q9NQV7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRDM9Q9NQV7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRDM9Q9NQV7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRDM9Q9NQV7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRDM9Q9NQV7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRDM9Q9NQV7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRDM9Q9NQV7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PRDM9Q9NQV7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRDM9Q9NQV7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRDM9Q9NQV7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRDM9Q9NQV7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRDM9Q9NQV7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM9Q9NQV7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM9Q9NQV7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM9Q9NQV7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM9Q9NQV7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM9Q9NQV7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM9Q9NQV7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRDM9Q9NQV7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRDM9Q9NQV7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRDM9Q9NQV7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PRDM9Q9NQV7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRDM9Q9NQV7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRDM9Q9NQV7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PRDM9Q9NQV7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PRDM9Q9NQV7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRDM9Q9NQV7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRDM9Q9NQV7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRDM9Q9NQV7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PRDM9Q9NQV7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PRDM9Q9NQV7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRDM9Q9NQV7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRDM9Q9NQV7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRDM9Q9NQV7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRDM9Q9NQV7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRDM9Q9NQV7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRDM9Q9NQV7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRDM9Q9NQV7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRDM9Q9NQV7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRDM9Q9NQV7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms