Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR7

CCDC177, Coiled-coil domain-containing protein 177, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC177Q9NQR7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC177Q9NQR7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC177Q9NQR7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC177Q9NQR7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC177Q9NQR7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC177Q9NQR7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC177Q9NQR7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC177Q9NQR7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC177Q9NQR7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC177Q9NQR7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC177Q9NQR7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC177Q9NQR7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC177Q9NQR7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC177Q9NQR7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC177Q9NQR7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC177Q9NQR7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC177Q9NQR7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC177Q9NQR7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC177Q9NQR7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC177Q9NQR7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC177Q9NQR7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC177Q9NQR7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC177Q9NQR7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC177Q9NQR7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC177Q9NQR7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC177Q9NQR7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC177Q9NQR7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC177Q9NQR7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC177Q9NQR7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC177Q9NQR7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC177Q9NQR7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC177Q9NQR7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC177Q9NQR7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC177Q9NQR7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC177Q9NQR7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC177Q9NQR7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC177Q9NQR7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC177Q9NQR7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC177Q9NQR7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC177Q9NQR7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC177Q9NQR7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC177Q9NQR7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC177Q9NQR7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC177Q9NQR7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC177Q9NQR7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC177Q9NQR7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC177Q9NQR7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC177Q9NQR7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC177Q9NQR7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC177Q9NQR7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC177Q9NQR7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC177Q9NQR7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC177Q9NQR7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC177Q9NQR7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC177Q9NQR7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC177Q9NQR7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC177Q9NQR7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC177Q9NQR7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC177Q9NQR7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC177Q9NQR7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC177Q9NQR7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC177Q9NQR7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC177Q9NQR7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC177Q9NQR7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC177Q9NQR7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC177Q9NQR7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC177Q9NQR7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC177Q9NQR7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC177Q9NQR7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC177Q9NQR7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC177Q9NQR7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC177Q9NQR7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC177Q9NQR7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC177Q9NQR7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC177Q9NQR7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC177Q9NQR7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC177Q9NQR7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC177Q9NQR7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC177Q9NQR7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC177Q9NQR7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC177Q9NQR7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC177Q9NQR7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC177Q9NQR7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC177Q9NQR7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC177Q9NQR7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC177Q9NQR7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC177Q9NQR7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC177Q9NQR7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC177Q9NQR7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC177Q9NQR7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC177Q9NQR7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC177Q9NQR7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC177Q9NQR7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC177Q9NQR7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC177Q9NQR7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC177Q9NQR7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC177Q9NQR7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC177Q9NQR7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC177Q9NQR7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC177Q9NQR7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms