Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU1

MCOLN1, Mucolipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN1Q9GZU1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MCOLN1Q9GZU1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MCOLN1Q9GZU1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MCOLN1Q9GZU1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
MCOLN1Q9GZU1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MCOLN1Q9GZU1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MCOLN1Q9GZU1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCOLN1Q9GZU1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCOLN1Q9GZU1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCOLN1Q9GZU1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCOLN1Q9GZU1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCOLN1Q9GZU1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MCOLN1Q9GZU1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MCOLN1Q9GZU1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MCOLN1Q9GZU1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MCOLN1Q9GZU1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MCOLN1Q9GZU1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCOLN1Q9GZU1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
MCOLN1Q9GZU1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCOLN1Q9GZU1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCOLN1Q9GZU1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCOLN1Q9GZU1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCOLN1Q9GZU1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCOLN1Q9GZU1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCOLN1Q9GZU1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCOLN1Q9GZU1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MCOLN1Q9GZU1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MCOLN1Q9GZU1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MCOLN1Q9GZU1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MCOLN1Q9GZU1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
MCOLN1Q9GZU1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MCOLN1Q9GZU1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
MCOLN1Q9GZU1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCOLN1Q9GZU1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCOLN1Q9GZU1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCOLN1Q9GZU1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
MCOLN1Q9GZU1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCOLN1Q9GZU1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCOLN1Q9GZU1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCOLN1Q9GZU1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCOLN1Q9GZU1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
MCOLN1Q9GZU1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCOLN1Q9GZU1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCOLN1Q9GZU1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCOLN1Q9GZU1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
MCOLN1Q9GZU1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MCOLN1Q9GZU1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MCOLN1Q9GZU1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MCOLN1Q9GZU1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MCOLN1Q9GZU1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MCOLN1Q9GZU1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MCOLN1Q9GZU1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MCOLN1Q9GZU1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MCOLN1Q9GZU1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MCOLN1Q9GZU1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
MCOLN1Q9GZU1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
MCOLN1Q9GZU1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MCOLN1Q9GZU1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MCOLN1Q9GZU1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MCOLN1Q9GZU1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MCOLN1Q9GZU1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MCOLN1Q9GZU1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MCOLN1Q9GZU1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MCOLN1Q9GZU1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MCOLN1Q9GZU1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCOLN1Q9GZU1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCOLN1Q9GZU1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCOLN1Q9GZU1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCOLN1Q9GZU1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCOLN1Q9GZU1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCOLN1Q9GZU1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCOLN1Q9GZU1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCOLN1Q9GZU1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCOLN1Q9GZU1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
MCOLN1Q9GZU1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MCOLN1Q9GZU1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MCOLN1Q9GZU1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MCOLN1Q9GZU1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MCOLN1Q9GZU1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MCOLN1Q9GZU1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MCOLN1Q9GZU1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MCOLN1Q9GZU1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MCOLN1Q9GZU1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MCOLN1Q9GZU1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MCOLN1Q9GZU1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MCOLN1Q9GZU1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MCOLN1Q9GZU1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MCOLN1Q9GZU1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MCOLN1Q9GZU1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MCOLN1Q9GZU1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MCOLN1Q9GZU1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MCOLN1Q9GZU1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MCOLN1Q9GZU1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MCOLN1Q9GZU1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MCOLN1Q9GZU1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MCOLN1Q9GZU1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MCOLN1Q9GZU1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MCOLN1Q9GZU1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MCOLN1Q9GZU1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCOLN1Q9GZU1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms