Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD6

MRPL1, 39S ribosomal protein L1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL1Q9BYD6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRPL1Q9BYD6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRPL1Q9BYD6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRPL1Q9BYD6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRPL1Q9BYD6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRPL1Q9BYD6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MRPL1Q9BYD6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRPL1Q9BYD6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRPL1Q9BYD6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRPL1Q9BYD6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRPL1Q9BYD6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRPL1Q9BYD6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRPL1Q9BYD6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRPL1Q9BYD6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRPL1Q9BYD6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRPL1Q9BYD6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRPL1Q9BYD6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRPL1Q9BYD6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRPL1Q9BYD6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRPL1Q9BYD6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRPL1Q9BYD6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRPL1Q9BYD6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRPL1Q9BYD6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRPL1Q9BYD6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRPL1Q9BYD6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRPL1Q9BYD6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRPL1Q9BYD6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRPL1Q9BYD6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MRPL1Q9BYD6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRPL1Q9BYD6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRPL1Q9BYD6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRPL1Q9BYD6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MRPL1Q9BYD6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRPL1Q9BYD6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRPL1Q9BYD6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRPL1Q9BYD6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRPL1Q9BYD6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRPL1Q9BYD6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRPL1Q9BYD6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRPL1Q9BYD6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPL1Q9BYD6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPL1Q9BYD6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPL1Q9BYD6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPL1Q9BYD6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPL1Q9BYD6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPL1Q9BYD6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPL1Q9BYD6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPL1Q9BYD6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPL1Q9BYD6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPL1Q9BYD6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPL1Q9BYD6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPL1Q9BYD6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPL1Q9BYD6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPL1Q9BYD6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPL1Q9BYD6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPL1Q9BYD6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPL1Q9BYD6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPL1Q9BYD6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPL1Q9BYD6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPL1Q9BYD6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPL1Q9BYD6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPL1Q9BYD6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPL1Q9BYD6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPL1Q9BYD6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPL1Q9BYD6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MRPL1Q9BYD6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MRPL1Q9BYD6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MRPL1Q9BYD6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MRPL1Q9BYD6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRPL1Q9BYD6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRPL1Q9BYD6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRPL1Q9BYD6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MRPL1Q9BYD6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRPL1Q9BYD6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPL1Q9BYD6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPL1Q9BYD6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPL1Q9BYD6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPL1Q9BYD6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRPL1Q9BYD6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MRPL1Q9BYD6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRPL1Q9BYD6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRPL1Q9BYD6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRPL1Q9BYD6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRPL1Q9BYD6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRPL1Q9BYD6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRPL1Q9BYD6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRPL1Q9BYD6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRPL1Q9BYD6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRPL1Q9BYD6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRPL1Q9BYD6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRPL1Q9BYD6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRPL1Q9BYD6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRPL1Q9BYD6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRPL1Q9BYD6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRPL1Q9BYD6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRPL1Q9BYD6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRPL1Q9BYD6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRPL1Q9BYD6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRPL1Q9BYD6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRPL1Q9BYD6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms