Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA7

TSSK1B, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK1BQ9BXA7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSSK1BQ9BXA7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSSK1BQ9BXA7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSSK1BQ9BXA7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSSK1BQ9BXA7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSSK1BQ9BXA7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSSK1BQ9BXA7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSSK1BQ9BXA7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSSK1BQ9BXA7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSSK1BQ9BXA7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSSK1BQ9BXA7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSSK1BQ9BXA7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSSK1BQ9BXA7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TSSK1BQ9BXA7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSSK1BQ9BXA7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TSSK1BQ9BXA7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSSK1BQ9BXA7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSSK1BQ9BXA7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSSK1BQ9BXA7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TSSK1BQ9BXA7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSSK1BQ9BXA7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSSK1BQ9BXA7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSSK1BQ9BXA7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TSSK1BQ9BXA7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSSK1BQ9BXA7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSSK1BQ9BXA7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSSK1BQ9BXA7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSSK1BQ9BXA7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSSK1BQ9BXA7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSSK1BQ9BXA7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSSK1BQ9BXA7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TSSK1BQ9BXA7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSSK1BQ9BXA7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSSK1BQ9BXA7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSSK1BQ9BXA7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSSK1BQ9BXA7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSSK1BQ9BXA7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSSK1BQ9BXA7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSSK1BQ9BXA7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TSSK1BQ9BXA7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSSK1BQ9BXA7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSSK1BQ9BXA7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSSK1BQ9BXA7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSSK1BQ9BXA7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSSK1BQ9BXA7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSSK1BQ9BXA7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSSK1BQ9BXA7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms