Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDFIP1Q9BT67 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDFIP1Q9BT67 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDFIP1Q9BT67 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDFIP1Q9BT67 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDFIP1Q9BT67 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDFIP1Q9BT67 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDFIP1Q9BT67 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDFIP1Q9BT67 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDFIP1Q9BT67 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDFIP1Q9BT67 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDFIP1Q9BT67 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDFIP1Q9BT67 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDFIP1Q9BT67 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDFIP1Q9BT67 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDFIP1Q9BT67 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDFIP1Q9BT67 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDFIP1Q9BT67 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDFIP1Q9BT67 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDFIP1Q9BT67 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NDFIP1Q9BT67 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDFIP1Q9BT67 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDFIP1Q9BT67 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDFIP1Q9BT67 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDFIP1Q9BT67 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NDFIP1Q9BT67 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDFIP1Q9BT67 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDFIP1Q9BT67 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDFIP1Q9BT67 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDFIP1Q9BT67 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDFIP1Q9BT67 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDFIP1Q9BT67 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NDFIP1Q9BT67 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDFIP1Q9BT67 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDFIP1Q9BT67 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDFIP1Q9BT67 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDFIP1Q9BT67 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDFIP1Q9BT67 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDFIP1Q9BT67 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDFIP1Q9BT67 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDFIP1Q9BT67 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDFIP1Q9BT67 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDFIP1Q9BT67 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDFIP1Q9BT67 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDFIP1Q9BT67 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDFIP1Q9BT67 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDFIP1Q9BT67 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDFIP1Q9BT67 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDFIP1Q9BT67 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDFIP1Q9BT67 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDFIP1Q9BT67 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDFIP1Q9BT67 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDFIP1Q9BT67 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDFIP1Q9BT67 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDFIP1Q9BT67 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDFIP1Q9BT67 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDFIP1Q9BT67 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDFIP1Q9BT67 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDFIP1Q9BT67 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDFIP1Q9BT67 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDFIP1Q9BT67 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDFIP1Q9BT67 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDFIP1Q9BT67 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDFIP1Q9BT67 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDFIP1Q9BT67 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDFIP1Q9BT67 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDFIP1Q9BT67 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDFIP1Q9BT67 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDFIP1Q9BT67 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NDFIP1Q9BT67 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NDFIP1Q9BT67 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NDFIP1Q9BT67 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NDFIP1Q9BT67 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NDFIP1Q9BT67 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NDFIP1Q9BT67 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NDFIP1Q9BT67 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NDFIP1Q9BT67 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NDFIP1Q9BT67 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NDFIP1Q9BT67 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NDFIP1Q9BT67 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NDFIP1Q9BT67 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NDFIP1Q9BT67 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NDFIP1Q9BT67 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NDFIP1Q9BT67 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NDFIP1Q9BT67 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NDFIP1Q9BT67 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NDFIP1Q9BT67 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NDFIP1Q9BT67 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NDFIP1Q9BT67 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NDFIP1Q9BT67 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NDFIP1Q9BT67 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NDFIP1Q9BT67 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NDFIP1Q9BT67 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NDFIP1Q9BT67 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NDFIP1Q9BT67 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NDFIP1Q9BT67 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NDFIP1Q9BT67 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NDFIP1Q9BT67 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDFIP1Q9BT67 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDFIP1Q9BT67 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.7 ms