Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GPA33Q99795 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPA33Q99795 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPA33Q99795 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPA33Q99795 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPA33Q99795 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPA33Q99795 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPA33Q99795 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPA33Q99795 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPA33Q99795 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPA33Q99795 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPA33Q99795 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPA33Q99795 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPA33Q99795 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPA33Q99795 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPA33Q99795 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPA33Q99795 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPA33Q99795 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPA33Q99795 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPA33Q99795 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPA33Q99795 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GPA33Q99795 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPA33Q99795 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPA33Q99795 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPA33Q99795 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPA33Q99795 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPA33Q99795 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPA33Q99795 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPA33Q99795 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GPA33Q99795 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPA33Q99795 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPA33Q99795 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPA33Q99795 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPA33Q99795 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPA33Q99795 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPA33Q99795 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPA33Q99795 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPA33Q99795 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GPA33Q99795 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GPA33Q99795 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GPA33Q99795 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GPA33Q99795 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GPA33Q99795 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPA33Q99795 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPA33Q99795 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPA33Q99795 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPA33Q99795 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPA33Q99795 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPA33Q99795 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GPA33Q99795 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPA33Q99795 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPA33Q99795 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPA33Q99795 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPA33Q99795 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPA33Q99795 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPA33Q99795 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPA33Q99795 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPA33Q99795 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPA33Q99795 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPA33Q99795 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPA33Q99795 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPA33Q99795 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPA33Q99795 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPA33Q99795 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPA33Q99795 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GPA33Q99795 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPA33Q99795 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPA33Q99795 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPA33Q99795 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPA33Q99795 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPA33Q99795 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPA33Q99795 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPA33Q99795 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPA33Q99795 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPA33Q99795 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GPA33Q99795 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPA33Q99795 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GPA33Q99795 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPA33Q99795 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPA33Q99795 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPA33Q99795 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GPA33Q99795 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPA33Q99795 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPA33Q99795 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GPA33Q99795 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPA33Q99795 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPA33Q99795 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPA33Q99795 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPA33Q99795 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
GPA33Q99795 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GPA33Q99795 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPA33Q99795 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPA33Q99795 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPA33Q99795 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPA33Q99795 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPA33Q99795 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPA33Q99795 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPA33Q99795 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPA33Q99795 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPA33Q99795 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms