Protein–RNA interactions for Protein: Q99700

ATXN2, Ataxin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN2Q99700 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATXN2Q99700 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATXN2Q99700 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATXN2Q99700 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATXN2Q99700 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATXN2Q99700 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATXN2Q99700 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATXN2Q99700 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATXN2Q99700 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ATXN2Q99700 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATXN2Q99700 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATXN2Q99700 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATXN2Q99700 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATXN2Q99700 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATXN2Q99700 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATXN2Q99700 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATXN2Q99700 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATXN2Q99700 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATXN2Q99700 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATXN2Q99700 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATXN2Q99700 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATXN2Q99700 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ATXN2Q99700 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATXN2Q99700 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ATXN2Q99700 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATXN2Q99700 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATXN2Q99700 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATXN2Q99700 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATXN2Q99700 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATXN2Q99700 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATXN2Q99700 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATXN2Q99700 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ATXN2Q99700 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ATXN2Q99700 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ATXN2Q99700 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
ATXN2Q99700 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATXN2Q99700 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATXN2Q99700 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATXN2Q99700 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATXN2Q99700 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATXN2Q99700 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATXN2Q99700 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATXN2Q99700 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATXN2Q99700 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATXN2Q99700 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATXN2Q99700 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATXN2Q99700 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATXN2Q99700 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATXN2Q99700 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATXN2Q99700 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATXN2Q99700 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATXN2Q99700 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATXN2Q99700 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATXN2Q99700 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ATXN2Q99700 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATXN2Q99700 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATXN2Q99700 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATXN2Q99700 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATXN2Q99700 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATXN2Q99700 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATXN2Q99700 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATXN2Q99700 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATXN2Q99700 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATXN2Q99700 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATXN2Q99700 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATXN2Q99700 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATXN2Q99700 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATXN2Q99700 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATXN2Q99700 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATXN2Q99700 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATXN2Q99700 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATXN2Q99700 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATXN2Q99700 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATXN2Q99700 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATXN2Q99700 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATXN2Q99700 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATXN2Q99700 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATXN2Q99700 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATXN2Q99700 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATXN2Q99700 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATXN2Q99700 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATXN2Q99700 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATXN2Q99700 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATXN2Q99700 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATXN2Q99700 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATXN2Q99700 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATXN2Q99700 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATXN2Q99700 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATXN2Q99700 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATXN2Q99700 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATXN2Q99700 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATXN2Q99700 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATXN2Q99700 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATXN2Q99700 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATXN2Q99700 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATXN2Q99700 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATXN2Q99700 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATXN2Q99700 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATXN2Q99700 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATXN2Q99700 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms