Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
UIMC1Q96RL1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
UIMC1Q96RL1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.03
UIMC1Q96RL1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
UIMC1Q96RL1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
UIMC1Q96RL1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
UIMC1Q96RL1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
UIMC1Q96RL1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UIMC1Q96RL1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
UIMC1Q96RL1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UIMC1Q96RL1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
UIMC1Q96RL1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
UIMC1Q96RL1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
UIMC1Q96RL1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
UIMC1Q96RL1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UIMC1Q96RL1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UIMC1Q96RL1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UIMC1Q96RL1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UIMC1Q96RL1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UIMC1Q96RL1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UIMC1Q96RL1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UIMC1Q96RL1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UIMC1Q96RL1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UIMC1Q96RL1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
UIMC1Q96RL1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
UIMC1Q96RL1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
UIMC1Q96RL1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UIMC1Q96RL1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
UIMC1Q96RL1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
UIMC1Q96RL1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UIMC1Q96RL1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
UIMC1Q96RL1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
UIMC1Q96RL1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UIMC1Q96RL1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UIMC1Q96RL1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
UIMC1Q96RL1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UIMC1Q96RL1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
UIMC1Q96RL1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UIMC1Q96RL1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UIMC1Q96RL1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
UIMC1Q96RL1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
UIMC1Q96RL1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UIMC1Q96RL1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UIMC1Q96RL1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
UIMC1Q96RL1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UIMC1Q96RL1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UIMC1Q96RL1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UIMC1Q96RL1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UIMC1Q96RL1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UIMC1Q96RL1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UIMC1Q96RL1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UIMC1Q96RL1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UIMC1Q96RL1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UIMC1Q96RL1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UIMC1Q96RL1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UIMC1Q96RL1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UIMC1Q96RL1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UIMC1Q96RL1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UIMC1Q96RL1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
UIMC1Q96RL1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UIMC1Q96RL1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UIMC1Q96RL1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
UIMC1Q96RL1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
UIMC1Q96RL1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UIMC1Q96RL1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UIMC1Q96RL1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
UIMC1Q96RL1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
UIMC1Q96RL1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UIMC1Q96RL1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
UIMC1Q96RL1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UIMC1Q96RL1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UIMC1Q96RL1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UIMC1Q96RL1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
UIMC1Q96RL1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UIMC1Q96RL1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
UIMC1Q96RL1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
UIMC1Q96RL1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UIMC1Q96RL1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
UIMC1Q96RL1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UIMC1Q96RL1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UIMC1Q96RL1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UIMC1Q96RL1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UIMC1Q96RL1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
UIMC1Q96RL1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UIMC1Q96RL1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
UIMC1Q96RL1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
UIMC1Q96RL1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UIMC1Q96RL1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UIMC1Q96RL1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UIMC1Q96RL1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
UIMC1Q96RL1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.52■■■□□ 2
UIMC1Q96RL1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UIMC1Q96RL1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
UIMC1Q96RL1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UIMC1Q96RL1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UIMC1Q96RL1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
UIMC1Q96RL1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UIMC1Q96RL1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UIMC1Q96RL1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
UIMC1Q96RL1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155 ms