Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ALS2Q96Q42 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ALS2Q96Q42 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ALS2Q96Q42 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ALS2Q96Q42 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ALS2Q96Q42 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ALS2Q96Q42 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
ALS2Q96Q42 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ALS2Q96Q42 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ALS2Q96Q42 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ALS2Q96Q42 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ALS2Q96Q42 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ALS2Q96Q42 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
ALS2Q96Q42 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ALS2Q96Q42 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ALS2Q96Q42 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ALS2Q96Q42 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ALS2Q96Q42 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ALS2Q96Q42 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ALS2Q96Q42 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
ALS2Q96Q42 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
ALS2Q96Q42 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ALS2Q96Q42 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
ALS2Q96Q42 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ALS2Q96Q42 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ALS2Q96Q42 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ALS2Q96Q42 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ALS2Q96Q42 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ALS2Q96Q42 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ALS2Q96Q42 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ALS2Q96Q42 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ALS2Q96Q42 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ALS2Q96Q42 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ALS2Q96Q42 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ALS2Q96Q42 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ALS2Q96Q42 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ALS2Q96Q42 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ALS2Q96Q42 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ALS2Q96Q42 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ALS2Q96Q42 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ALS2Q96Q42 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ALS2Q96Q42 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ALS2Q96Q42 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ALS2Q96Q42 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ALS2Q96Q42 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ALS2Q96Q42 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ALS2Q96Q42 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ALS2Q96Q42 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ALS2Q96Q42 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ALS2Q96Q42 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ALS2Q96Q42 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ALS2Q96Q42 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ALS2Q96Q42 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ALS2Q96Q42 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ALS2Q96Q42 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ALS2Q96Q42 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ALS2Q96Q42 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
ALS2Q96Q42 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
ALS2Q96Q42 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ALS2Q96Q42 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ALS2Q96Q42 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ALS2Q96Q42 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ALS2Q96Q42 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ALS2Q96Q42 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ALS2Q96Q42 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ALS2Q96Q42 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ALS2Q96Q42 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ALS2Q96Q42 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ALS2Q96Q42 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ALS2Q96Q42 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ALS2Q96Q42 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ALS2Q96Q42 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ALS2Q96Q42 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ALS2Q96Q42 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ALS2Q96Q42 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ALS2Q96Q42 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ALS2Q96Q42 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ALS2Q96Q42 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ALS2Q96Q42 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ALS2Q96Q42 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ALS2Q96Q42 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ALS2Q96Q42 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ALS2Q96Q42 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ALS2Q96Q42 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ALS2Q96Q42 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ALS2Q96Q42 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ALS2Q96Q42 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ALS2Q96Q42 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ALS2Q96Q42 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ALS2Q96Q42 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
ALS2Q96Q42 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
ALS2Q96Q42 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
ALS2Q96Q42 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ALS2Q96Q42 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
ALS2Q96Q42 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
ALS2Q96Q42 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
ALS2Q96Q42 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
ALS2Q96Q42 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
ALS2Q96Q42 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ALS2Q96Q42 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms