Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU0

CNTNAP3B, Contactin-associated protein-like 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3BQ96NU0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTNAP3BQ96NU0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTNAP3BQ96NU0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTNAP3BQ96NU0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTNAP3BQ96NU0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTNAP3BQ96NU0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTNAP3BQ96NU0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTNAP3BQ96NU0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTNAP3BQ96NU0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTNAP3BQ96NU0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTNAP3BQ96NU0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTNAP3BQ96NU0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTNAP3BQ96NU0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP3BQ96NU0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP3BQ96NU0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP3BQ96NU0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP3BQ96NU0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP3BQ96NU0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP3BQ96NU0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP3BQ96NU0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP3BQ96NU0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP3BQ96NU0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP3BQ96NU0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP3BQ96NU0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTNAP3BQ96NU0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTNAP3BQ96NU0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTNAP3BQ96NU0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTNAP3BQ96NU0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTNAP3BQ96NU0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTNAP3BQ96NU0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP3BQ96NU0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP3BQ96NU0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP3BQ96NU0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP3BQ96NU0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP3BQ96NU0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP3BQ96NU0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP3BQ96NU0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CNTNAP3BQ96NU0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTNAP3BQ96NU0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTNAP3BQ96NU0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTNAP3BQ96NU0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTNAP3BQ96NU0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTNAP3BQ96NU0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP3BQ96NU0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP3BQ96NU0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP3BQ96NU0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP3BQ96NU0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP3BQ96NU0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP3BQ96NU0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP3BQ96NU0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP3BQ96NU0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP3BQ96NU0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP3BQ96NU0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP3BQ96NU0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP3BQ96NU0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP3BQ96NU0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP3BQ96NU0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP3BQ96NU0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP3BQ96NU0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP3BQ96NU0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP3BQ96NU0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP3BQ96NU0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP3BQ96NU0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP3BQ96NU0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP3BQ96NU0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP3BQ96NU0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP3BQ96NU0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP3BQ96NU0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP3BQ96NU0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP3BQ96NU0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP3BQ96NU0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTNAP3BQ96NU0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTNAP3BQ96NU0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTNAP3BQ96NU0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTNAP3BQ96NU0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTNAP3BQ96NU0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP3BQ96NU0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP3BQ96NU0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP3BQ96NU0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP3BQ96NU0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP3BQ96NU0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP3BQ96NU0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP3BQ96NU0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP3BQ96NU0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP3BQ96NU0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP3BQ96NU0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP3BQ96NU0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP3BQ96NU0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP3BQ96NU0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP3BQ96NU0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP3BQ96NU0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP3BQ96NU0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP3BQ96NU0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTNAP3BQ96NU0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTNAP3BQ96NU0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTNAP3BQ96NU0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTNAP3BQ96NU0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTNAP3BQ96NU0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTNAP3BQ96NU0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTNAP3BQ96NU0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms