Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPZA3Q96KX2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPZA3Q96KX2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPZA3Q96KX2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPZA3Q96KX2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPZA3Q96KX2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPZA3Q96KX2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPZA3Q96KX2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPZA3Q96KX2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPZA3Q96KX2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPZA3Q96KX2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPZA3Q96KX2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPZA3Q96KX2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPZA3Q96KX2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAPZA3Q96KX2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAPZA3Q96KX2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAPZA3Q96KX2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAPZA3Q96KX2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAPZA3Q96KX2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAPZA3Q96KX2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPZA3Q96KX2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPZA3Q96KX2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPZA3Q96KX2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPZA3Q96KX2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPZA3Q96KX2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPZA3Q96KX2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPZA3Q96KX2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPZA3Q96KX2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPZA3Q96KX2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPZA3Q96KX2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPZA3Q96KX2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPZA3Q96KX2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPZA3Q96KX2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPZA3Q96KX2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPZA3Q96KX2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPZA3Q96KX2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPZA3Q96KX2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPZA3Q96KX2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPZA3Q96KX2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPZA3Q96KX2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPZA3Q96KX2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPZA3Q96KX2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPZA3Q96KX2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPZA3Q96KX2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPZA3Q96KX2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPZA3Q96KX2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPZA3Q96KX2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPZA3Q96KX2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPZA3Q96KX2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPZA3Q96KX2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPZA3Q96KX2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPZA3Q96KX2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPZA3Q96KX2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPZA3Q96KX2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPZA3Q96KX2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPZA3Q96KX2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPZA3Q96KX2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPZA3Q96KX2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPZA3Q96KX2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPZA3Q96KX2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPZA3Q96KX2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPZA3Q96KX2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPZA3Q96KX2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CAPZA3Q96KX2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPZA3Q96KX2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPZA3Q96KX2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPZA3Q96KX2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPZA3Q96KX2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPZA3Q96KX2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPZA3Q96KX2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPZA3Q96KX2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPZA3Q96KX2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPZA3Q96KX2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPZA3Q96KX2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPZA3Q96KX2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPZA3Q96KX2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPZA3Q96KX2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPZA3Q96KX2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPZA3Q96KX2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPZA3Q96KX2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPZA3Q96KX2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPZA3Q96KX2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPZA3Q96KX2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPZA3Q96KX2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPZA3Q96KX2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPZA3Q96KX2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPZA3Q96KX2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPZA3Q96KX2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPZA3Q96KX2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPZA3Q96KX2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPZA3Q96KX2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPZA3Q96KX2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPZA3Q96KX2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPZA3Q96KX2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPZA3Q96KX2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPZA3Q96KX2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPZA3Q96KX2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPZA3Q96KX2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPZA3Q96KX2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPZA3Q96KX2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms