Protein–RNA interactions for Protein: Q96H12

MSANTD3, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSANTD3Q96H12 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MSANTD3Q96H12 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MSANTD3Q96H12 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MSANTD3Q96H12 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MSANTD3Q96H12 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MSANTD3Q96H12 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MSANTD3Q96H12 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MSANTD3Q96H12 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSANTD3Q96H12 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MSANTD3Q96H12 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSANTD3Q96H12 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSANTD3Q96H12 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSANTD3Q96H12 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSANTD3Q96H12 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSANTD3Q96H12 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSANTD3Q96H12 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MSANTD3Q96H12 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MSANTD3Q96H12 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MSANTD3Q96H12 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSANTD3Q96H12 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSANTD3Q96H12 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSANTD3Q96H12 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MSANTD3Q96H12 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSANTD3Q96H12 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MSANTD3Q96H12 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MSANTD3Q96H12 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MSANTD3Q96H12 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MSANTD3Q96H12 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MSANTD3Q96H12 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MSANTD3Q96H12 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MSANTD3Q96H12 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MSANTD3Q96H12 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSANTD3Q96H12 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSANTD3Q96H12 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSANTD3Q96H12 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSANTD3Q96H12 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSANTD3Q96H12 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MSANTD3Q96H12 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSANTD3Q96H12 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSANTD3Q96H12 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSANTD3Q96H12 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MSANTD3Q96H12 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MSANTD3Q96H12 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MSANTD3Q96H12 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSANTD3Q96H12 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSANTD3Q96H12 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSANTD3Q96H12 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSANTD3Q96H12 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSANTD3Q96H12 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSANTD3Q96H12 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSANTD3Q96H12 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSANTD3Q96H12 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSANTD3Q96H12 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSANTD3Q96H12 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MSANTD3Q96H12 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSANTD3Q96H12 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSANTD3Q96H12 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSANTD3Q96H12 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MSANTD3Q96H12 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MSANTD3Q96H12 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MSANTD3Q96H12 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MSANTD3Q96H12 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSANTD3Q96H12 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSANTD3Q96H12 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSANTD3Q96H12 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSANTD3Q96H12 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSANTD3Q96H12 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSANTD3Q96H12 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSANTD3Q96H12 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MSANTD3Q96H12 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MSANTD3Q96H12 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MSANTD3Q96H12 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MSANTD3Q96H12 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MSANTD3Q96H12 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MSANTD3Q96H12 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MSANTD3Q96H12 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSANTD3Q96H12 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSANTD3Q96H12 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSANTD3Q96H12 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSANTD3Q96H12 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MSANTD3Q96H12 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSANTD3Q96H12 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSANTD3Q96H12 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSANTD3Q96H12 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSANTD3Q96H12 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSANTD3Q96H12 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSANTD3Q96H12 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSANTD3Q96H12 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSANTD3Q96H12 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSANTD3Q96H12 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSANTD3Q96H12 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSANTD3Q96H12 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSANTD3Q96H12 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MSANTD3Q96H12 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSANTD3Q96H12 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSANTD3Q96H12 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSANTD3Q96H12 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSANTD3Q96H12 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSANTD3Q96H12 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSANTD3Q96H12 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms