Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FAM3DQ96BQ1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM3DQ96BQ1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM3DQ96BQ1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM3DQ96BQ1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM3DQ96BQ1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM3DQ96BQ1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
FAM3DQ96BQ1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
FAM3DQ96BQ1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
FAM3DQ96BQ1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
FAM3DQ96BQ1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
FAM3DQ96BQ1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM3DQ96BQ1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM3DQ96BQ1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM3DQ96BQ1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM3DQ96BQ1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM3DQ96BQ1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM3DQ96BQ1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM3DQ96BQ1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM3DQ96BQ1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM3DQ96BQ1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM3DQ96BQ1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM3DQ96BQ1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM3DQ96BQ1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM3DQ96BQ1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM3DQ96BQ1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM3DQ96BQ1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM3DQ96BQ1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM3DQ96BQ1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM3DQ96BQ1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM3DQ96BQ1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM3DQ96BQ1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM3DQ96BQ1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM3DQ96BQ1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM3DQ96BQ1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM3DQ96BQ1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM3DQ96BQ1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM3DQ96BQ1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM3DQ96BQ1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM3DQ96BQ1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM3DQ96BQ1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM3DQ96BQ1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM3DQ96BQ1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM3DQ96BQ1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM3DQ96BQ1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM3DQ96BQ1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM3DQ96BQ1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM3DQ96BQ1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM3DQ96BQ1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM3DQ96BQ1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM3DQ96BQ1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM3DQ96BQ1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM3DQ96BQ1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM3DQ96BQ1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM3DQ96BQ1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM3DQ96BQ1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM3DQ96BQ1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM3DQ96BQ1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FAM3DQ96BQ1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FAM3DQ96BQ1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FAM3DQ96BQ1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
FAM3DQ96BQ1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FAM3DQ96BQ1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FAM3DQ96BQ1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FAM3DQ96BQ1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM3DQ96BQ1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM3DQ96BQ1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM3DQ96BQ1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM3DQ96BQ1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM3DQ96BQ1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM3DQ96BQ1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM3DQ96BQ1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM3DQ96BQ1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM3DQ96BQ1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM3DQ96BQ1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM3DQ96BQ1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM3DQ96BQ1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM3DQ96BQ1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM3DQ96BQ1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM3DQ96BQ1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM3DQ96BQ1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM3DQ96BQ1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM3DQ96BQ1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM3DQ96BQ1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM3DQ96BQ1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM3DQ96BQ1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM3DQ96BQ1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM3DQ96BQ1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM3DQ96BQ1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM3DQ96BQ1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM3DQ96BQ1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM3DQ96BQ1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM3DQ96BQ1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM3DQ96BQ1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM3DQ96BQ1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM3DQ96BQ1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM3DQ96BQ1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM3DQ96BQ1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM3DQ96BQ1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM3DQ96BQ1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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