Protein–RNA interactions for Protein: Q96B42

TMEM18, Transmembrane protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM18Q96B42 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM18Q96B42 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM18Q96B42 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM18Q96B42 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM18Q96B42 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM18Q96B42 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM18Q96B42 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM18Q96B42 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM18Q96B42 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM18Q96B42 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM18Q96B42 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM18Q96B42 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
TMEM18Q96B42 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM18Q96B42 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM18Q96B42 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM18Q96B42 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM18Q96B42 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM18Q96B42 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM18Q96B42 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM18Q96B42 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM18Q96B42 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM18Q96B42 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM18Q96B42 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM18Q96B42 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM18Q96B42 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM18Q96B42 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM18Q96B42 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM18Q96B42 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM18Q96B42 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM18Q96B42 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM18Q96B42 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM18Q96B42 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM18Q96B42 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM18Q96B42 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM18Q96B42 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM18Q96B42 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM18Q96B42 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM18Q96B42 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM18Q96B42 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM18Q96B42 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM18Q96B42 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM18Q96B42 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM18Q96B42 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM18Q96B42 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM18Q96B42 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM18Q96B42 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM18Q96B42 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM18Q96B42 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM18Q96B42 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM18Q96B42 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM18Q96B42 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM18Q96B42 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM18Q96B42 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM18Q96B42 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM18Q96B42 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM18Q96B42 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM18Q96B42 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM18Q96B42 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM18Q96B42 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM18Q96B42 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM18Q96B42 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM18Q96B42 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM18Q96B42 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM18Q96B42 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM18Q96B42 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM18Q96B42 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM18Q96B42 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM18Q96B42 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM18Q96B42 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM18Q96B42 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM18Q96B42 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM18Q96B42 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM18Q96B42 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM18Q96B42 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM18Q96B42 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM18Q96B42 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM18Q96B42 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM18Q96B42 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM18Q96B42 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM18Q96B42 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM18Q96B42 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM18Q96B42 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM18Q96B42 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM18Q96B42 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM18Q96B42 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM18Q96B42 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM18Q96B42 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM18Q96B42 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM18Q96B42 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM18Q96B42 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM18Q96B42 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM18Q96B42 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM18Q96B42 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM18Q96B42 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM18Q96B42 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM18Q96B42 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM18Q96B42 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM18Q96B42 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM18Q96B42 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM18Q96B42 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms