Protein–RNA interactions for Protein: Q969G2

LHX4, LIM/homeobox protein Lhx4, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX4Q969G2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LHX4Q969G2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LHX4Q969G2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LHX4Q969G2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LHX4Q969G2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LHX4Q969G2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LHX4Q969G2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LHX4Q969G2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LHX4Q969G2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LHX4Q969G2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LHX4Q969G2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LHX4Q969G2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LHX4Q969G2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LHX4Q969G2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LHX4Q969G2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LHX4Q969G2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LHX4Q969G2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LHX4Q969G2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LHX4Q969G2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LHX4Q969G2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LHX4Q969G2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LHX4Q969G2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LHX4Q969G2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LHX4Q969G2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LHX4Q969G2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LHX4Q969G2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LHX4Q969G2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LHX4Q969G2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LHX4Q969G2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LHX4Q969G2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LHX4Q969G2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX4Q969G2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX4Q969G2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX4Q969G2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX4Q969G2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX4Q969G2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX4Q969G2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX4Q969G2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX4Q969G2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX4Q969G2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX4Q969G2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX4Q969G2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX4Q969G2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX4Q969G2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX4Q969G2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX4Q969G2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX4Q969G2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX4Q969G2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX4Q969G2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX4Q969G2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX4Q969G2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX4Q969G2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX4Q969G2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX4Q969G2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX4Q969G2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX4Q969G2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX4Q969G2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX4Q969G2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX4Q969G2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX4Q969G2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX4Q969G2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX4Q969G2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX4Q969G2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX4Q969G2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX4Q969G2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX4Q969G2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX4Q969G2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX4Q969G2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX4Q969G2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX4Q969G2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX4Q969G2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX4Q969G2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX4Q969G2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX4Q969G2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX4Q969G2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX4Q969G2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX4Q969G2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX4Q969G2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX4Q969G2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX4Q969G2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX4Q969G2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX4Q969G2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX4Q969G2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX4Q969G2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX4Q969G2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX4Q969G2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX4Q969G2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX4Q969G2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX4Q969G2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX4Q969G2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX4Q969G2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX4Q969G2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX4Q969G2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX4Q969G2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX4Q969G2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX4Q969G2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX4Q969G2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX4Q969G2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms