Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWX9

SELENOM, Selenoprotein M, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOMQ8WWX9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SELENOMQ8WWX9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SELENOMQ8WWX9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SELENOMQ8WWX9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SELENOMQ8WWX9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SELENOMQ8WWX9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SELENOMQ8WWX9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SELENOMQ8WWX9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SELENOMQ8WWX9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SELENOMQ8WWX9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SELENOMQ8WWX9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SELENOMQ8WWX9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SELENOMQ8WWX9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SELENOMQ8WWX9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SELENOMQ8WWX9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SELENOMQ8WWX9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SELENOMQ8WWX9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SELENOMQ8WWX9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SELENOMQ8WWX9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SELENOMQ8WWX9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SELENOMQ8WWX9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
SELENOMQ8WWX9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SELENOMQ8WWX9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SELENOMQ8WWX9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SELENOMQ8WWX9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SELENOMQ8WWX9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SELENOMQ8WWX9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SELENOMQ8WWX9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SELENOMQ8WWX9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SELENOMQ8WWX9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SELENOMQ8WWX9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SELENOMQ8WWX9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SELENOMQ8WWX9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SELENOMQ8WWX9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SELENOMQ8WWX9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SELENOMQ8WWX9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SELENOMQ8WWX9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SELENOMQ8WWX9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SELENOMQ8WWX9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SELENOMQ8WWX9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SELENOMQ8WWX9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SELENOMQ8WWX9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SELENOMQ8WWX9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SELENOMQ8WWX9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SELENOMQ8WWX9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SELENOMQ8WWX9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SELENOMQ8WWX9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SELENOMQ8WWX9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SELENOMQ8WWX9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SELENOMQ8WWX9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SELENOMQ8WWX9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SELENOMQ8WWX9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SELENOMQ8WWX9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SELENOMQ8WWX9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SELENOMQ8WWX9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SELENOMQ8WWX9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SELENOMQ8WWX9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SELENOMQ8WWX9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SELENOMQ8WWX9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SELENOMQ8WWX9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SELENOMQ8WWX9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SELENOMQ8WWX9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SELENOMQ8WWX9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SELENOMQ8WWX9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SELENOMQ8WWX9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SELENOMQ8WWX9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SELENOMQ8WWX9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SELENOMQ8WWX9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SELENOMQ8WWX9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SELENOMQ8WWX9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SELENOMQ8WWX9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SELENOMQ8WWX9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SELENOMQ8WWX9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SELENOMQ8WWX9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SELENOMQ8WWX9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SELENOMQ8WWX9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SELENOMQ8WWX9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SELENOMQ8WWX9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SELENOMQ8WWX9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SELENOMQ8WWX9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SELENOMQ8WWX9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SELENOMQ8WWX9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SELENOMQ8WWX9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SELENOMQ8WWX9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SELENOMQ8WWX9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SELENOMQ8WWX9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SELENOMQ8WWX9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SELENOMQ8WWX9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SELENOMQ8WWX9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SELENOMQ8WWX9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SELENOMQ8WWX9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SELENOMQ8WWX9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SELENOMQ8WWX9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SELENOMQ8WWX9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SELENOMQ8WWX9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SELENOMQ8WWX9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SELENOMQ8WWX9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SELENOMQ8WWX9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SELENOMQ8WWX9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SELENOMQ8WWX9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms