Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW34

TMEM239, Transmembrane protein 239, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM239Q8WW34 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM239Q8WW34 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM239Q8WW34 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM239Q8WW34 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMEM239Q8WW34 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM239Q8WW34 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM239Q8WW34 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM239Q8WW34 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM239Q8WW34 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM239Q8WW34 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM239Q8WW34 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM239Q8WW34 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM239Q8WW34 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM239Q8WW34 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM239Q8WW34 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM239Q8WW34 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM239Q8WW34 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM239Q8WW34 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM239Q8WW34 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM239Q8WW34 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM239Q8WW34 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM239Q8WW34 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM239Q8WW34 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM239Q8WW34 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM239Q8WW34 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM239Q8WW34 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM239Q8WW34 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM239Q8WW34 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM239Q8WW34 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM239Q8WW34 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM239Q8WW34 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM239Q8WW34 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM239Q8WW34 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM239Q8WW34 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM239Q8WW34 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM239Q8WW34 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM239Q8WW34 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM239Q8WW34 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM239Q8WW34 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM239Q8WW34 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM239Q8WW34 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM239Q8WW34 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM239Q8WW34 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM239Q8WW34 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM239Q8WW34 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM239Q8WW34 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM239Q8WW34 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM239Q8WW34 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM239Q8WW34 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM239Q8WW34 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM239Q8WW34 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM239Q8WW34 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM239Q8WW34 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM239Q8WW34 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM239Q8WW34 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM239Q8WW34 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM239Q8WW34 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM239Q8WW34 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM239Q8WW34 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM239Q8WW34 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM239Q8WW34 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM239Q8WW34 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM239Q8WW34 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM239Q8WW34 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM239Q8WW34 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM239Q8WW34 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM239Q8WW34 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM239Q8WW34 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM239Q8WW34 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM239Q8WW34 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM239Q8WW34 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM239Q8WW34 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM239Q8WW34 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM239Q8WW34 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM239Q8WW34 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM239Q8WW34 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM239Q8WW34 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM239Q8WW34 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM239Q8WW34 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM239Q8WW34 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM239Q8WW34 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM239Q8WW34 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM239Q8WW34 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM239Q8WW34 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM239Q8WW34 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM239Q8WW34 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM239Q8WW34 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM239Q8WW34 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM239Q8WW34 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM239Q8WW34 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM239Q8WW34 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM239Q8WW34 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM239Q8WW34 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM239Q8WW34 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM239Q8WW34 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM239Q8WW34 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM239Q8WW34 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM239Q8WW34 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM239Q8WW34 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM239Q8WW34 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms