Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DCAF4Q8WV16 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DCAF4Q8WV16 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DCAF4Q8WV16 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DCAF4Q8WV16 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DCAF4Q8WV16 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DCAF4Q8WV16 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DCAF4Q8WV16 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DCAF4Q8WV16 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DCAF4Q8WV16 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DCAF4Q8WV16 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
DCAF4Q8WV16 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DCAF4Q8WV16 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DCAF4Q8WV16 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DCAF4Q8WV16 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DCAF4Q8WV16 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DCAF4Q8WV16 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DCAF4Q8WV16 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DCAF4Q8WV16 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DCAF4Q8WV16 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DCAF4Q8WV16 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
DCAF4Q8WV16 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DCAF4Q8WV16 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
DCAF4Q8WV16 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DCAF4Q8WV16 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DCAF4Q8WV16 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DCAF4Q8WV16 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DCAF4Q8WV16 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
DCAF4Q8WV16 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DCAF4Q8WV16 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DCAF4Q8WV16 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DCAF4Q8WV16 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DCAF4Q8WV16 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DCAF4Q8WV16 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DCAF4Q8WV16 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DCAF4Q8WV16 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DCAF4Q8WV16 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DCAF4Q8WV16 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DCAF4Q8WV16 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DCAF4Q8WV16 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DCAF4Q8WV16 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DCAF4Q8WV16 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DCAF4Q8WV16 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DCAF4Q8WV16 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DCAF4Q8WV16 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DCAF4Q8WV16 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DCAF4Q8WV16 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DCAF4Q8WV16 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DCAF4Q8WV16 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DCAF4Q8WV16 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DCAF4Q8WV16 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DCAF4Q8WV16 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DCAF4Q8WV16 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DCAF4Q8WV16 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DCAF4Q8WV16 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DCAF4Q8WV16 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DCAF4Q8WV16 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DCAF4Q8WV16 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DCAF4Q8WV16 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DCAF4Q8WV16 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DCAF4Q8WV16 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DCAF4Q8WV16 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DCAF4Q8WV16 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DCAF4Q8WV16 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DCAF4Q8WV16 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DCAF4Q8WV16 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
DCAF4Q8WV16 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DCAF4Q8WV16 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DCAF4Q8WV16 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DCAF4Q8WV16 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DCAF4Q8WV16 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DCAF4Q8WV16 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DCAF4Q8WV16 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DCAF4Q8WV16 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DCAF4Q8WV16 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DCAF4Q8WV16 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DCAF4Q8WV16 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DCAF4Q8WV16 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DCAF4Q8WV16 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DCAF4Q8WV16 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DCAF4Q8WV16 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
DCAF4Q8WV16 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DCAF4Q8WV16 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DCAF4Q8WV16 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DCAF4Q8WV16 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DCAF4Q8WV16 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
DCAF4Q8WV16 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DCAF4Q8WV16 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
DCAF4Q8WV16 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DCAF4Q8WV16 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DCAF4Q8WV16 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DCAF4Q8WV16 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DCAF4Q8WV16 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DCAF4Q8WV16 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DCAF4Q8WV16 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DCAF4Q8WV16 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DCAF4Q8WV16 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DCAF4Q8WV16 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DCAF4Q8WV16 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DCAF4Q8WV16 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.9 ms