Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF42

UBASH3B, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, humanhuman

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3BQ8TF42 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBASH3BQ8TF42 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBASH3BQ8TF42 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBASH3BQ8TF42 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
UBASH3BQ8TF42 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBASH3BQ8TF42 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBASH3BQ8TF42 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBASH3BQ8TF42 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBASH3BQ8TF42 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBASH3BQ8TF42 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBASH3BQ8TF42 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBASH3BQ8TF42 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBASH3BQ8TF42 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBASH3BQ8TF42 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBASH3BQ8TF42 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBASH3BQ8TF42 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBASH3BQ8TF42 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBASH3BQ8TF42 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBASH3BQ8TF42 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBASH3BQ8TF42 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBASH3BQ8TF42 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBASH3BQ8TF42 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBASH3BQ8TF42 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBASH3BQ8TF42 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBASH3BQ8TF42 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBASH3BQ8TF42 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBASH3BQ8TF42 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBASH3BQ8TF42 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBASH3BQ8TF42 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBASH3BQ8TF42 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBASH3BQ8TF42 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBASH3BQ8TF42 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBASH3BQ8TF42 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBASH3BQ8TF42 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBASH3BQ8TF42 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBASH3BQ8TF42 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBASH3BQ8TF42 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
UBASH3BQ8TF42 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBASH3BQ8TF42 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBASH3BQ8TF42 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBASH3BQ8TF42 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBASH3BQ8TF42 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBASH3BQ8TF42 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBASH3BQ8TF42 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBASH3BQ8TF42 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBASH3BQ8TF42 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBASH3BQ8TF42 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBASH3BQ8TF42 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBASH3BQ8TF42 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBASH3BQ8TF42 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBASH3BQ8TF42 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBASH3BQ8TF42 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBASH3BQ8TF42 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
UBASH3BQ8TF42 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
UBASH3BQ8TF42 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBASH3BQ8TF42 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBASH3BQ8TF42 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBASH3BQ8TF42 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBASH3BQ8TF42 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBASH3BQ8TF42 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBASH3BQ8TF42 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBASH3BQ8TF42 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBASH3BQ8TF42 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBASH3BQ8TF42 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBASH3BQ8TF42 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBASH3BQ8TF42 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBASH3BQ8TF42 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
UBASH3BQ8TF42 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBASH3BQ8TF42 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBASH3BQ8TF42 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBASH3BQ8TF42 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBASH3BQ8TF42 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBASH3BQ8TF42 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBASH3BQ8TF42 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBASH3BQ8TF42 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBASH3BQ8TF42 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBASH3BQ8TF42 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBASH3BQ8TF42 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBASH3BQ8TF42 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBASH3BQ8TF42 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBASH3BQ8TF42 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBASH3BQ8TF42 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBASH3BQ8TF42 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
UBASH3BQ8TF42 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBASH3BQ8TF42 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBASH3BQ8TF42 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBASH3BQ8TF42 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBASH3BQ8TF42 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBASH3BQ8TF42 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBASH3BQ8TF42 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBASH3BQ8TF42 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBASH3BQ8TF42 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBASH3BQ8TF42 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBASH3BQ8TF42 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBASH3BQ8TF42 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBASH3BQ8TF42 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBASH3BQ8TF42 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBASH3BQ8TF42 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBASH3BQ8TF42 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBASH3BQ8TF42 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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