Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNX29Q8TEQ0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SNX29Q8TEQ0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SNX29Q8TEQ0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SNX29Q8TEQ0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SNX29Q8TEQ0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SNX29Q8TEQ0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNX29Q8TEQ0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SNX29Q8TEQ0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNX29Q8TEQ0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNX29Q8TEQ0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNX29Q8TEQ0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNX29Q8TEQ0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNX29Q8TEQ0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNX29Q8TEQ0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNX29Q8TEQ0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNX29Q8TEQ0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNX29Q8TEQ0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNX29Q8TEQ0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNX29Q8TEQ0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNX29Q8TEQ0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNX29Q8TEQ0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNX29Q8TEQ0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNX29Q8TEQ0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNX29Q8TEQ0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNX29Q8TEQ0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SNX29Q8TEQ0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNX29Q8TEQ0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNX29Q8TEQ0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNX29Q8TEQ0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNX29Q8TEQ0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNX29Q8TEQ0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SNX29Q8TEQ0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNX29Q8TEQ0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNX29Q8TEQ0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNX29Q8TEQ0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNX29Q8TEQ0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNX29Q8TEQ0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNX29Q8TEQ0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX29Q8TEQ0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX29Q8TEQ0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX29Q8TEQ0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX29Q8TEQ0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNX29Q8TEQ0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SNX29Q8TEQ0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNX29Q8TEQ0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNX29Q8TEQ0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNX29Q8TEQ0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNX29Q8TEQ0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNX29Q8TEQ0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNX29Q8TEQ0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNX29Q8TEQ0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNX29Q8TEQ0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNX29Q8TEQ0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNX29Q8TEQ0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNX29Q8TEQ0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNX29Q8TEQ0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SNX29Q8TEQ0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNX29Q8TEQ0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNX29Q8TEQ0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNX29Q8TEQ0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNX29Q8TEQ0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNX29Q8TEQ0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNX29Q8TEQ0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SNX29Q8TEQ0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SNX29Q8TEQ0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNX29Q8TEQ0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNX29Q8TEQ0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SNX29Q8TEQ0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNX29Q8TEQ0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNX29Q8TEQ0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNX29Q8TEQ0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNX29Q8TEQ0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SNX29Q8TEQ0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNX29Q8TEQ0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SNX29Q8TEQ0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNX29Q8TEQ0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNX29Q8TEQ0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNX29Q8TEQ0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNX29Q8TEQ0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNX29Q8TEQ0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNX29Q8TEQ0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNX29Q8TEQ0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNX29Q8TEQ0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNX29Q8TEQ0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNX29Q8TEQ0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SNX29Q8TEQ0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNX29Q8TEQ0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNX29Q8TEQ0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNX29Q8TEQ0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNX29Q8TEQ0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNX29Q8TEQ0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNX29Q8TEQ0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNX29Q8TEQ0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNX29Q8TEQ0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNX29Q8TEQ0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNX29Q8TEQ0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX29Q8TEQ0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX29Q8TEQ0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX29Q8TEQ0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms