Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HELQQ8TDG4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HELQQ8TDG4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HELQQ8TDG4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
HELQQ8TDG4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HELQQ8TDG4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HELQQ8TDG4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HELQQ8TDG4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HELQQ8TDG4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HELQQ8TDG4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HELQQ8TDG4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HELQQ8TDG4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HELQQ8TDG4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HELQQ8TDG4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HELQQ8TDG4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HELQQ8TDG4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HELQQ8TDG4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
HELQQ8TDG4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
HELQQ8TDG4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HELQQ8TDG4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HELQQ8TDG4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HELQQ8TDG4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HELQQ8TDG4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HELQQ8TDG4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HELQQ8TDG4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HELQQ8TDG4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HELQQ8TDG4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HELQQ8TDG4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HELQQ8TDG4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HELQQ8TDG4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HELQQ8TDG4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HELQQ8TDG4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HELQQ8TDG4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
HELQQ8TDG4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HELQQ8TDG4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HELQQ8TDG4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HELQQ8TDG4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HELQQ8TDG4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HELQQ8TDG4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HELQQ8TDG4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HELQQ8TDG4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HELQQ8TDG4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HELQQ8TDG4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HELQQ8TDG4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HELQQ8TDG4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HELQQ8TDG4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HELQQ8TDG4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HELQQ8TDG4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HELQQ8TDG4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HELQQ8TDG4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
HELQQ8TDG4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HELQQ8TDG4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HELQQ8TDG4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HELQQ8TDG4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HELQQ8TDG4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HELQQ8TDG4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HELQQ8TDG4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HELQQ8TDG4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HELQQ8TDG4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HELQQ8TDG4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HELQQ8TDG4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HELQQ8TDG4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HELQQ8TDG4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HELQQ8TDG4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
HELQQ8TDG4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HELQQ8TDG4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HELQQ8TDG4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HELQQ8TDG4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HELQQ8TDG4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HELQQ8TDG4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
HELQQ8TDG4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HELQQ8TDG4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HELQQ8TDG4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HELQQ8TDG4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HELQQ8TDG4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HELQQ8TDG4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HELQQ8TDG4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HELQQ8TDG4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HELQQ8TDG4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HELQQ8TDG4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HELQQ8TDG4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HELQQ8TDG4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HELQQ8TDG4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HELQQ8TDG4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
HELQQ8TDG4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HELQQ8TDG4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HELQQ8TDG4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HELQQ8TDG4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HELQQ8TDG4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HELQQ8TDG4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
HELQQ8TDG4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HELQQ8TDG4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HELQQ8TDG4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HELQQ8TDG4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HELQQ8TDG4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HELQQ8TDG4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HELQQ8TDG4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HELQQ8TDG4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HELQQ8TDG4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HELQQ8TDG4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms