Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FNDC9Q8TBE3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FNDC9Q8TBE3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FNDC9Q8TBE3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FNDC9Q8TBE3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FNDC9Q8TBE3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FNDC9Q8TBE3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FNDC9Q8TBE3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FNDC9Q8TBE3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FNDC9Q8TBE3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FNDC9Q8TBE3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FNDC9Q8TBE3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FNDC9Q8TBE3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FNDC9Q8TBE3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FNDC9Q8TBE3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FNDC9Q8TBE3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FNDC9Q8TBE3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FNDC9Q8TBE3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FNDC9Q8TBE3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FNDC9Q8TBE3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FNDC9Q8TBE3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FNDC9Q8TBE3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FNDC9Q8TBE3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FNDC9Q8TBE3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
FNDC9Q8TBE3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FNDC9Q8TBE3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FNDC9Q8TBE3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FNDC9Q8TBE3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FNDC9Q8TBE3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FNDC9Q8TBE3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FNDC9Q8TBE3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FNDC9Q8TBE3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FNDC9Q8TBE3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FNDC9Q8TBE3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FNDC9Q8TBE3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FNDC9Q8TBE3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FNDC9Q8TBE3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FNDC9Q8TBE3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FNDC9Q8TBE3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FNDC9Q8TBE3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FNDC9Q8TBE3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FNDC9Q8TBE3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FNDC9Q8TBE3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FNDC9Q8TBE3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FNDC9Q8TBE3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FNDC9Q8TBE3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FNDC9Q8TBE3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FNDC9Q8TBE3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FNDC9Q8TBE3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNDC9Q8TBE3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNDC9Q8TBE3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNDC9Q8TBE3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNDC9Q8TBE3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNDC9Q8TBE3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNDC9Q8TBE3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNDC9Q8TBE3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNDC9Q8TBE3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNDC9Q8TBE3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNDC9Q8TBE3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms