Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CARMIL3Q8ND23 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CARMIL3Q8ND23 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
CARMIL3Q8ND23 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CARMIL3Q8ND23 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CARMIL3Q8ND23 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CARMIL3Q8ND23 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CARMIL3Q8ND23 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CARMIL3Q8ND23 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CARMIL3Q8ND23 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CARMIL3Q8ND23 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CARMIL3Q8ND23 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CARMIL3Q8ND23 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CARMIL3Q8ND23 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CARMIL3Q8ND23 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CARMIL3Q8ND23 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
CARMIL3Q8ND23 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CARMIL3Q8ND23 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CARMIL3Q8ND23 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CARMIL3Q8ND23 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CARMIL3Q8ND23 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CARMIL3Q8ND23 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CARMIL3Q8ND23 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CARMIL3Q8ND23 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CARMIL3Q8ND23 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CARMIL3Q8ND23 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CARMIL3Q8ND23 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CARMIL3Q8ND23 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CARMIL3Q8ND23 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CARMIL3Q8ND23 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
CARMIL3Q8ND23 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CARMIL3Q8ND23 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CARMIL3Q8ND23 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CARMIL3Q8ND23 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CARMIL3Q8ND23 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CARMIL3Q8ND23 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CARMIL3Q8ND23 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CARMIL3Q8ND23 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CARMIL3Q8ND23 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CARMIL3Q8ND23 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CARMIL3Q8ND23 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CARMIL3Q8ND23 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CARMIL3Q8ND23 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CARMIL3Q8ND23 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CARMIL3Q8ND23 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CARMIL3Q8ND23 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CARMIL3Q8ND23 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CARMIL3Q8ND23 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CARMIL3Q8ND23 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CARMIL3Q8ND23 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CARMIL3Q8ND23 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CARMIL3Q8ND23 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CARMIL3Q8ND23 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CARMIL3Q8ND23 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CARMIL3Q8ND23 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CARMIL3Q8ND23 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CARMIL3Q8ND23 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CARMIL3Q8ND23 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CARMIL3Q8ND23 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CARMIL3Q8ND23 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CARMIL3Q8ND23 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CARMIL3Q8ND23 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CARMIL3Q8ND23 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CARMIL3Q8ND23 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CARMIL3Q8ND23 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CARMIL3Q8ND23 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CARMIL3Q8ND23 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CARMIL3Q8ND23 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CARMIL3Q8ND23 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CARMIL3Q8ND23 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CARMIL3Q8ND23 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CARMIL3Q8ND23 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CARMIL3Q8ND23 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CARMIL3Q8ND23 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
CARMIL3Q8ND23 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CARMIL3Q8ND23 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CARMIL3Q8ND23 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CARMIL3Q8ND23 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CARMIL3Q8ND23 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CARMIL3Q8ND23 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
CARMIL3Q8ND23 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CARMIL3Q8ND23 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CARMIL3Q8ND23 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CARMIL3Q8ND23 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CARMIL3Q8ND23 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CARMIL3Q8ND23 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CARMIL3Q8ND23 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CARMIL3Q8ND23 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CARMIL3Q8ND23 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
CARMIL3Q8ND23 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CARMIL3Q8ND23 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
CARMIL3Q8ND23 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CARMIL3Q8ND23 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
CARMIL3Q8ND23 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CARMIL3Q8ND23 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CARMIL3Q8ND23 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CARMIL3Q8ND23 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CARMIL3Q8ND23 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CARMIL3Q8ND23 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CARMIL3Q8ND23 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms