Protein–RNA interactions for Protein: Q8N988

ZNF557, Zinc finger protein 557, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF557Q8N988 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF557Q8N988 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF557Q8N988 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF557Q8N988 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF557Q8N988 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF557Q8N988 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF557Q8N988 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF557Q8N988 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF557Q8N988 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF557Q8N988 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF557Q8N988 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF557Q8N988 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF557Q8N988 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF557Q8N988 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF557Q8N988 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZNF557Q8N988 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZNF557Q8N988 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF557Q8N988 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF557Q8N988 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF557Q8N988 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF557Q8N988 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF557Q8N988 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF557Q8N988 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF557Q8N988 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF557Q8N988 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF557Q8N988 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF557Q8N988 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF557Q8N988 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF557Q8N988 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF557Q8N988 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF557Q8N988 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF557Q8N988 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF557Q8N988 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF557Q8N988 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF557Q8N988 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF557Q8N988 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF557Q8N988 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF557Q8N988 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF557Q8N988 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF557Q8N988 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF557Q8N988 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF557Q8N988 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF557Q8N988 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF557Q8N988 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF557Q8N988 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF557Q8N988 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF557Q8N988 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF557Q8N988 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF557Q8N988 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF557Q8N988 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF557Q8N988 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF557Q8N988 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF557Q8N988 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF557Q8N988 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF557Q8N988 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF557Q8N988 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF557Q8N988 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF557Q8N988 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF557Q8N988 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF557Q8N988 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF557Q8N988 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF557Q8N988 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF557Q8N988 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF557Q8N988 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF557Q8N988 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF557Q8N988 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF557Q8N988 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF557Q8N988 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF557Q8N988 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF557Q8N988 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF557Q8N988 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF557Q8N988 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF557Q8N988 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF557Q8N988 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF557Q8N988 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF557Q8N988 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF557Q8N988 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF557Q8N988 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF557Q8N988 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF557Q8N988 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF557Q8N988 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF557Q8N988 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF557Q8N988 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF557Q8N988 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF557Q8N988 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZNF557Q8N988 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF557Q8N988 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF557Q8N988 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF557Q8N988 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF557Q8N988 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF557Q8N988 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF557Q8N988 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF557Q8N988 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF557Q8N988 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF557Q8N988 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF557Q8N988 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF557Q8N988 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF557Q8N988 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF557Q8N988 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF557Q8N988 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms