Protein–RNA interactions for Protein: Q8N187

CARF, Calcium-responsive transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARFQ8N187 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARFQ8N187 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARFQ8N187 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARFQ8N187 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARFQ8N187 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARFQ8N187 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARFQ8N187 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CARFQ8N187 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CARFQ8N187 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARFQ8N187 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARFQ8N187 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARFQ8N187 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARFQ8N187 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARFQ8N187 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARFQ8N187 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARFQ8N187 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARFQ8N187 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CARFQ8N187 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CARFQ8N187 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CARFQ8N187 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CARFQ8N187 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CARFQ8N187 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CARFQ8N187 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CARFQ8N187 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CARFQ8N187 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CARFQ8N187 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CARFQ8N187 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CARFQ8N187 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CARFQ8N187 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CARFQ8N187 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CARFQ8N187 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CARFQ8N187 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CARFQ8N187 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CARFQ8N187 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CARFQ8N187 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CARFQ8N187 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CARFQ8N187 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CARFQ8N187 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CARFQ8N187 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CARFQ8N187 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CARFQ8N187 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CARFQ8N187 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CARFQ8N187 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CARFQ8N187 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CARFQ8N187 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CARFQ8N187 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CARFQ8N187 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CARFQ8N187 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CARFQ8N187 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CARFQ8N187 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CARFQ8N187 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CARFQ8N187 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CARFQ8N187 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CARFQ8N187 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CARFQ8N187 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CARFQ8N187 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CARFQ8N187 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CARFQ8N187 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CARFQ8N187 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CARFQ8N187 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CARFQ8N187 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CARFQ8N187 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CARFQ8N187 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CARFQ8N187 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CARFQ8N187 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CARFQ8N187 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CARFQ8N187 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CARFQ8N187 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CARFQ8N187 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CARFQ8N187 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CARFQ8N187 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARFQ8N187 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARFQ8N187 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARFQ8N187 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARFQ8N187 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARFQ8N187 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CARFQ8N187 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARFQ8N187 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARFQ8N187 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARFQ8N187 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARFQ8N187 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARFQ8N187 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARFQ8N187 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARFQ8N187 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARFQ8N187 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARFQ8N187 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARFQ8N187 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARFQ8N187 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARFQ8N187 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARFQ8N187 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARFQ8N187 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARFQ8N187 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CARFQ8N187 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CARFQ8N187 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CARFQ8N187 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CARFQ8N187 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CARFQ8N187 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CARFQ8N187 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CARFQ8N187 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CARFQ8N187 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms