Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZM8

ZNF654, Zinc finger protein 654, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF654Q8IZM8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNF654Q8IZM8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNF654Q8IZM8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNF654Q8IZM8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNF654Q8IZM8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF654Q8IZM8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF654Q8IZM8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF654Q8IZM8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF654Q8IZM8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF654Q8IZM8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZNF654Q8IZM8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZNF654Q8IZM8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF654Q8IZM8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF654Q8IZM8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF654Q8IZM8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF654Q8IZM8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNF654Q8IZM8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNF654Q8IZM8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNF654Q8IZM8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNF654Q8IZM8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZNF654Q8IZM8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZNF654Q8IZM8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZNF654Q8IZM8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZNF654Q8IZM8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF654Q8IZM8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF654Q8IZM8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF654Q8IZM8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNF654Q8IZM8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNF654Q8IZM8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF654Q8IZM8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF654Q8IZM8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF654Q8IZM8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF654Q8IZM8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF654Q8IZM8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF654Q8IZM8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF654Q8IZM8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF654Q8IZM8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF654Q8IZM8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ZNF654Q8IZM8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZNF654Q8IZM8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF654Q8IZM8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF654Q8IZM8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF654Q8IZM8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF654Q8IZM8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF654Q8IZM8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF654Q8IZM8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF654Q8IZM8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF654Q8IZM8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF654Q8IZM8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF654Q8IZM8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF654Q8IZM8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF654Q8IZM8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF654Q8IZM8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF654Q8IZM8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF654Q8IZM8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF654Q8IZM8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF654Q8IZM8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF654Q8IZM8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNF654Q8IZM8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNF654Q8IZM8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNF654Q8IZM8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNF654Q8IZM8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNF654Q8IZM8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNF654Q8IZM8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNF654Q8IZM8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF654Q8IZM8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF654Q8IZM8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF654Q8IZM8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF654Q8IZM8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF654Q8IZM8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF654Q8IZM8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF654Q8IZM8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF654Q8IZM8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF654Q8IZM8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF654Q8IZM8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF654Q8IZM8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ZNF654Q8IZM8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF654Q8IZM8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF654Q8IZM8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF654Q8IZM8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF654Q8IZM8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF654Q8IZM8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF654Q8IZM8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF654Q8IZM8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF654Q8IZM8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF654Q8IZM8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF654Q8IZM8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF654Q8IZM8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF654Q8IZM8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF654Q8IZM8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF654Q8IZM8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF654Q8IZM8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF654Q8IZM8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF654Q8IZM8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF654Q8IZM8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF654Q8IZM8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF654Q8IZM8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF654Q8IZM8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF654Q8IZM8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF654Q8IZM8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms