Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RPAP2Q8IXW5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
RPAP2Q8IXW5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
RPAP2Q8IXW5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
RPAP2Q8IXW5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RPAP2Q8IXW5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RPAP2Q8IXW5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RPAP2Q8IXW5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RPAP2Q8IXW5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RPAP2Q8IXW5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RPAP2Q8IXW5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RPAP2Q8IXW5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RPAP2Q8IXW5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RPAP2Q8IXW5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RPAP2Q8IXW5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
RPAP2Q8IXW5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RPAP2Q8IXW5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
RPAP2Q8IXW5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
RPAP2Q8IXW5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
RPAP2Q8IXW5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
RPAP2Q8IXW5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
RPAP2Q8IXW5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
RPAP2Q8IXW5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RPAP2Q8IXW5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RPAP2Q8IXW5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RPAP2Q8IXW5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RPAP2Q8IXW5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RPAP2Q8IXW5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RPAP2Q8IXW5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RPAP2Q8IXW5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RPAP2Q8IXW5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
RPAP2Q8IXW5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RPAP2Q8IXW5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RPAP2Q8IXW5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
RPAP2Q8IXW5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RPAP2Q8IXW5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RPAP2Q8IXW5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RPAP2Q8IXW5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RPAP2Q8IXW5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RPAP2Q8IXW5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RPAP2Q8IXW5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RPAP2Q8IXW5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RPAP2Q8IXW5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RPAP2Q8IXW5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RPAP2Q8IXW5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RPAP2Q8IXW5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RPAP2Q8IXW5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RPAP2Q8IXW5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RPAP2Q8IXW5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RPAP2Q8IXW5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
RPAP2Q8IXW5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RPAP2Q8IXW5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RPAP2Q8IXW5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RPAP2Q8IXW5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RPAP2Q8IXW5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RPAP2Q8IXW5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RPAP2Q8IXW5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RPAP2Q8IXW5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RPAP2Q8IXW5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RPAP2Q8IXW5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RPAP2Q8IXW5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RPAP2Q8IXW5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RPAP2Q8IXW5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RPAP2Q8IXW5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RPAP2Q8IXW5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RPAP2Q8IXW5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RPAP2Q8IXW5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RPAP2Q8IXW5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RPAP2Q8IXW5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RPAP2Q8IXW5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RPAP2Q8IXW5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RPAP2Q8IXW5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RPAP2Q8IXW5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RPAP2Q8IXW5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RPAP2Q8IXW5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RPAP2Q8IXW5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RPAP2Q8IXW5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RPAP2Q8IXW5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RPAP2Q8IXW5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RPAP2Q8IXW5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RPAP2Q8IXW5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
RPAP2Q8IXW5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RPAP2Q8IXW5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RPAP2Q8IXW5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RPAP2Q8IXW5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RPAP2Q8IXW5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RPAP2Q8IXW5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RPAP2Q8IXW5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
RPAP2Q8IXW5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RPAP2Q8IXW5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RPAP2Q8IXW5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RPAP2Q8IXW5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RPAP2Q8IXW5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RPAP2Q8IXW5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RPAP2Q8IXW5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RPAP2Q8IXW5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
RPAP2Q8IXW5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RPAP2Q8IXW5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
RPAP2Q8IXW5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RPAP2Q8IXW5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms