Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RAB11FIP4Q86YS3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RAB11FIP4Q86YS3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RAB11FIP4Q86YS3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAB11FIP4Q86YS3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAB11FIP4Q86YS3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAB11FIP4Q86YS3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAB11FIP4Q86YS3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAB11FIP4Q86YS3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAB11FIP4Q86YS3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAB11FIP4Q86YS3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAB11FIP4Q86YS3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAB11FIP4Q86YS3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAB11FIP4Q86YS3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RAB11FIP4Q86YS3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAB11FIP4Q86YS3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RAB11FIP4Q86YS3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RAB11FIP4Q86YS3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAB11FIP4Q86YS3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAB11FIP4Q86YS3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAB11FIP4Q86YS3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAB11FIP4Q86YS3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAB11FIP4Q86YS3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAB11FIP4Q86YS3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAB11FIP4Q86YS3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAB11FIP4Q86YS3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAB11FIP4Q86YS3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAB11FIP4Q86YS3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAB11FIP4Q86YS3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAB11FIP4Q86YS3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAB11FIP4Q86YS3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAB11FIP4Q86YS3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAB11FIP4Q86YS3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAB11FIP4Q86YS3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAB11FIP4Q86YS3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAB11FIP4Q86YS3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAB11FIP4Q86YS3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RAB11FIP4Q86YS3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAB11FIP4Q86YS3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAB11FIP4Q86YS3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAB11FIP4Q86YS3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAB11FIP4Q86YS3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAB11FIP4Q86YS3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAB11FIP4Q86YS3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAB11FIP4Q86YS3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RAB11FIP4Q86YS3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RAB11FIP4Q86YS3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RAB11FIP4Q86YS3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RAB11FIP4Q86YS3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RAB11FIP4Q86YS3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RAB11FIP4Q86YS3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RAB11FIP4Q86YS3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
RAB11FIP4Q86YS3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
RAB11FIP4Q86YS3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RAB11FIP4Q86YS3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RAB11FIP4Q86YS3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RAB11FIP4Q86YS3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RAB11FIP4Q86YS3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RAB11FIP4Q86YS3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RAB11FIP4Q86YS3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RAB11FIP4Q86YS3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RAB11FIP4Q86YS3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RAB11FIP4Q86YS3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RAB11FIP4Q86YS3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RAB11FIP4Q86YS3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RAB11FIP4Q86YS3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RAB11FIP4Q86YS3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RAB11FIP4Q86YS3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RAB11FIP4Q86YS3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RAB11FIP4Q86YS3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RAB11FIP4Q86YS3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RAB11FIP4Q86YS3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RAB11FIP4Q86YS3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RAB11FIP4Q86YS3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RAB11FIP4Q86YS3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
RAB11FIP4Q86YS3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RAB11FIP4Q86YS3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RAB11FIP4Q86YS3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RAB11FIP4Q86YS3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAB11FIP4Q86YS3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAB11FIP4Q86YS3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RAB11FIP4Q86YS3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RAB11FIP4Q86YS3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
RAB11FIP4Q86YS3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAB11FIP4Q86YS3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAB11FIP4Q86YS3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAB11FIP4Q86YS3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAB11FIP4Q86YS3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAB11FIP4Q86YS3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAB11FIP4Q86YS3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAB11FIP4Q86YS3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAB11FIP4Q86YS3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RAB11FIP4Q86YS3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAB11FIP4Q86YS3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAB11FIP4Q86YS3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAB11FIP4Q86YS3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms