Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR53Q7Z5U6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR53Q7Z5U6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR53Q7Z5U6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR53Q7Z5U6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR53Q7Z5U6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR53Q7Z5U6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR53Q7Z5U6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR53Q7Z5U6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR53Q7Z5U6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR53Q7Z5U6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR53Q7Z5U6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR53Q7Z5U6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR53Q7Z5U6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR53Q7Z5U6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR53Q7Z5U6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR53Q7Z5U6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR53Q7Z5U6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR53Q7Z5U6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR53Q7Z5U6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR53Q7Z5U6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR53Q7Z5U6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR53Q7Z5U6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR53Q7Z5U6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR53Q7Z5U6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR53Q7Z5U6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR53Q7Z5U6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR53Q7Z5U6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR53Q7Z5U6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR53Q7Z5U6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR53Q7Z5U6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR53Q7Z5U6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR53Q7Z5U6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR53Q7Z5U6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR53Q7Z5U6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR53Q7Z5U6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR53Q7Z5U6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR53Q7Z5U6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR53Q7Z5U6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR53Q7Z5U6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR53Q7Z5U6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR53Q7Z5U6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR53Q7Z5U6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR53Q7Z5U6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR53Q7Z5U6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR53Q7Z5U6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR53Q7Z5U6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR53Q7Z5U6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR53Q7Z5U6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR53Q7Z5U6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR53Q7Z5U6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR53Q7Z5U6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR53Q7Z5U6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR53Q7Z5U6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR53Q7Z5U6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR53Q7Z5U6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR53Q7Z5U6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR53Q7Z5U6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR53Q7Z5U6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR53Q7Z5U6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR53Q7Z5U6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR53Q7Z5U6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR53Q7Z5U6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR53Q7Z5U6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR53Q7Z5U6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR53Q7Z5U6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR53Q7Z5U6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR53Q7Z5U6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR53Q7Z5U6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR53Q7Z5U6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR53Q7Z5U6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR53Q7Z5U6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR53Q7Z5U6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR53Q7Z5U6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR53Q7Z5U6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR53Q7Z5U6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR53Q7Z5U6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR53Q7Z5U6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR53Q7Z5U6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR53Q7Z5U6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR53Q7Z5U6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR53Q7Z5U6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR53Q7Z5U6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR53Q7Z5U6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR53Q7Z5U6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR53Q7Z5U6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR53Q7Z5U6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR53Q7Z5U6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR53Q7Z5U6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR53Q7Z5U6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR53Q7Z5U6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR53Q7Z5U6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR53Q7Z5U6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR53Q7Z5U6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR53Q7Z5U6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR53Q7Z5U6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR53Q7Z5U6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR53Q7Z5U6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR53Q7Z5U6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR53Q7Z5U6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms