Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z422

SZRD1, SUZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1Q7Z422 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SZRD1Q7Z422 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SZRD1Q7Z422 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SZRD1Q7Z422 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SZRD1Q7Z422 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SZRD1Q7Z422 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SZRD1Q7Z422 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SZRD1Q7Z422 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SZRD1Q7Z422 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SZRD1Q7Z422 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SZRD1Q7Z422 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SZRD1Q7Z422 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SZRD1Q7Z422 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SZRD1Q7Z422 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SZRD1Q7Z422 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SZRD1Q7Z422 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SZRD1Q7Z422 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SZRD1Q7Z422 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SZRD1Q7Z422 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SZRD1Q7Z422 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SZRD1Q7Z422 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SZRD1Q7Z422 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SZRD1Q7Z422 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SZRD1Q7Z422 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SZRD1Q7Z422 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SZRD1Q7Z422 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SZRD1Q7Z422 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SZRD1Q7Z422 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SZRD1Q7Z422 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SZRD1Q7Z422 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SZRD1Q7Z422 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SZRD1Q7Z422 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SZRD1Q7Z422 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SZRD1Q7Z422 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SZRD1Q7Z422 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SZRD1Q7Z422 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SZRD1Q7Z422 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SZRD1Q7Z422 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SZRD1Q7Z422 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SZRD1Q7Z422 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SZRD1Q7Z422 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SZRD1Q7Z422 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SZRD1Q7Z422 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SZRD1Q7Z422 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SZRD1Q7Z422 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SZRD1Q7Z422 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SZRD1Q7Z422 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SZRD1Q7Z422 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SZRD1Q7Z422 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SZRD1Q7Z422 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SZRD1Q7Z422 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SZRD1Q7Z422 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SZRD1Q7Z422 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SZRD1Q7Z422 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SZRD1Q7Z422 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SZRD1Q7Z422 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SZRD1Q7Z422 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SZRD1Q7Z422 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SZRD1Q7Z422 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SZRD1Q7Z422 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SZRD1Q7Z422 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SZRD1Q7Z422 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SZRD1Q7Z422 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SZRD1Q7Z422 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SZRD1Q7Z422 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SZRD1Q7Z422 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SZRD1Q7Z422 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SZRD1Q7Z422 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SZRD1Q7Z422 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SZRD1Q7Z422 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SZRD1Q7Z422 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SZRD1Q7Z422 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SZRD1Q7Z422 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SZRD1Q7Z422 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SZRD1Q7Z422 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SZRD1Q7Z422 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SZRD1Q7Z422 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SZRD1Q7Z422 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SZRD1Q7Z422 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SZRD1Q7Z422 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SZRD1Q7Z422 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SZRD1Q7Z422 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SZRD1Q7Z422 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SZRD1Q7Z422 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SZRD1Q7Z422 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SZRD1Q7Z422 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SZRD1Q7Z422 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SZRD1Q7Z422 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SZRD1Q7Z422 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SZRD1Q7Z422 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SZRD1Q7Z422 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SZRD1Q7Z422 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SZRD1Q7Z422 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SZRD1Q7Z422 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SZRD1Q7Z422 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SZRD1Q7Z422 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SZRD1Q7Z422 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SZRD1Q7Z422 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SZRD1Q7Z422 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SZRD1Q7Z422 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms