Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BBS12Q6ZW61 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BBS12Q6ZW61 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BBS12Q6ZW61 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BBS12Q6ZW61 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BBS12Q6ZW61 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BBS12Q6ZW61 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BBS12Q6ZW61 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BBS12Q6ZW61 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BBS12Q6ZW61 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BBS12Q6ZW61 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BBS12Q6ZW61 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BBS12Q6ZW61 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BBS12Q6ZW61 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BBS12Q6ZW61 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BBS12Q6ZW61 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BBS12Q6ZW61 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BBS12Q6ZW61 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BBS12Q6ZW61 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BBS12Q6ZW61 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BBS12Q6ZW61 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BBS12Q6ZW61 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BBS12Q6ZW61 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BBS12Q6ZW61 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BBS12Q6ZW61 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BBS12Q6ZW61 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BBS12Q6ZW61 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BBS12Q6ZW61 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BBS12Q6ZW61 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BBS12Q6ZW61 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BBS12Q6ZW61 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BBS12Q6ZW61 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
BBS12Q6ZW61 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BBS12Q6ZW61 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BBS12Q6ZW61 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BBS12Q6ZW61 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BBS12Q6ZW61 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BBS12Q6ZW61 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BBS12Q6ZW61 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BBS12Q6ZW61 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BBS12Q6ZW61 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BBS12Q6ZW61 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BBS12Q6ZW61 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BBS12Q6ZW61 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BBS12Q6ZW61 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BBS12Q6ZW61 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BBS12Q6ZW61 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BBS12Q6ZW61 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BBS12Q6ZW61 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BBS12Q6ZW61 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BBS12Q6ZW61 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BBS12Q6ZW61 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BBS12Q6ZW61 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BBS12Q6ZW61 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BBS12Q6ZW61 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BBS12Q6ZW61 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BBS12Q6ZW61 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BBS12Q6ZW61 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BBS12Q6ZW61 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BBS12Q6ZW61 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BBS12Q6ZW61 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BBS12Q6ZW61 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BBS12Q6ZW61 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BBS12Q6ZW61 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BBS12Q6ZW61 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BBS12Q6ZW61 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BBS12Q6ZW61 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BBS12Q6ZW61 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BBS12Q6ZW61 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BBS12Q6ZW61 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BBS12Q6ZW61 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BBS12Q6ZW61 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
BBS12Q6ZW61 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BBS12Q6ZW61 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BBS12Q6ZW61 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BBS12Q6ZW61 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BBS12Q6ZW61 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BBS12Q6ZW61 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BBS12Q6ZW61 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BBS12Q6ZW61 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
BBS12Q6ZW61 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BBS12Q6ZW61 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BBS12Q6ZW61 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BBS12Q6ZW61 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BBS12Q6ZW61 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BBS12Q6ZW61 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
BBS12Q6ZW61 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BBS12Q6ZW61 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BBS12Q6ZW61 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BBS12Q6ZW61 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BBS12Q6ZW61 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BBS12Q6ZW61 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BBS12Q6ZW61 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BBS12Q6ZW61 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BBS12Q6ZW61 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BBS12Q6ZW61 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
BBS12Q6ZW61 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BBS12Q6ZW61 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BBS12Q6ZW61 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BBS12Q6ZW61 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms