Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYDE1Q6ZW31 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYDE1Q6ZW31 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYDE1Q6ZW31 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYDE1Q6ZW31 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYDE1Q6ZW31 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYDE1Q6ZW31 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYDE1Q6ZW31 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYDE1Q6ZW31 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SYDE1Q6ZW31 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYDE1Q6ZW31 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYDE1Q6ZW31 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SYDE1Q6ZW31 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYDE1Q6ZW31 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SYDE1Q6ZW31 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYDE1Q6ZW31 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYDE1Q6ZW31 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYDE1Q6ZW31 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SYDE1Q6ZW31 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYDE1Q6ZW31 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYDE1Q6ZW31 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYDE1Q6ZW31 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYDE1Q6ZW31 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYDE1Q6ZW31 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYDE1Q6ZW31 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYDE1Q6ZW31 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYDE1Q6ZW31 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYDE1Q6ZW31 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYDE1Q6ZW31 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYDE1Q6ZW31 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYDE1Q6ZW31 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYDE1Q6ZW31 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYDE1Q6ZW31 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SYDE1Q6ZW31 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYDE1Q6ZW31 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SYDE1Q6ZW31 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYDE1Q6ZW31 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SYDE1Q6ZW31 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYDE1Q6ZW31 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SYDE1Q6ZW31 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYDE1Q6ZW31 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYDE1Q6ZW31 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYDE1Q6ZW31 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYDE1Q6ZW31 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYDE1Q6ZW31 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYDE1Q6ZW31 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYDE1Q6ZW31 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYDE1Q6ZW31 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYDE1Q6ZW31 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SYDE1Q6ZW31 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYDE1Q6ZW31 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SYDE1Q6ZW31 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SYDE1Q6ZW31 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SYDE1Q6ZW31 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SYDE1Q6ZW31 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SYDE1Q6ZW31 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SYDE1Q6ZW31 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SYDE1Q6ZW31 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SYDE1Q6ZW31 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SYDE1Q6ZW31 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYDE1Q6ZW31 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYDE1Q6ZW31 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYDE1Q6ZW31 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYDE1Q6ZW31 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYDE1Q6ZW31 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYDE1Q6ZW31 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYDE1Q6ZW31 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYDE1Q6ZW31 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYDE1Q6ZW31 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYDE1Q6ZW31 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SYDE1Q6ZW31 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYDE1Q6ZW31 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYDE1Q6ZW31 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYDE1Q6ZW31 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYDE1Q6ZW31 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYDE1Q6ZW31 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYDE1Q6ZW31 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYDE1Q6ZW31 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYDE1Q6ZW31 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYDE1Q6ZW31 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYDE1Q6ZW31 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYDE1Q6ZW31 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYDE1Q6ZW31 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYDE1Q6ZW31 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYDE1Q6ZW31 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SYDE1Q6ZW31 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYDE1Q6ZW31 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYDE1Q6ZW31 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYDE1Q6ZW31 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYDE1Q6ZW31 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYDE1Q6ZW31 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYDE1Q6ZW31 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYDE1Q6ZW31 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYDE1Q6ZW31 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYDE1Q6ZW31 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYDE1Q6ZW31 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYDE1Q6ZW31 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYDE1Q6ZW31 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYDE1Q6ZW31 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYDE1Q6ZW31 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms