Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4U4

SOSTDC1, Sclerostin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOSTDC1Q6X4U4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOSTDC1Q6X4U4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOSTDC1Q6X4U4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOSTDC1Q6X4U4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOSTDC1Q6X4U4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOSTDC1Q6X4U4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOSTDC1Q6X4U4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOSTDC1Q6X4U4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOSTDC1Q6X4U4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOSTDC1Q6X4U4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOSTDC1Q6X4U4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOSTDC1Q6X4U4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOSTDC1Q6X4U4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOSTDC1Q6X4U4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOSTDC1Q6X4U4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOSTDC1Q6X4U4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOSTDC1Q6X4U4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOSTDC1Q6X4U4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOSTDC1Q6X4U4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOSTDC1Q6X4U4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SOSTDC1Q6X4U4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOSTDC1Q6X4U4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOSTDC1Q6X4U4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOSTDC1Q6X4U4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOSTDC1Q6X4U4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOSTDC1Q6X4U4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOSTDC1Q6X4U4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOSTDC1Q6X4U4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOSTDC1Q6X4U4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOSTDC1Q6X4U4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOSTDC1Q6X4U4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOSTDC1Q6X4U4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOSTDC1Q6X4U4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOSTDC1Q6X4U4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOSTDC1Q6X4U4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOSTDC1Q6X4U4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOSTDC1Q6X4U4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOSTDC1Q6X4U4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOSTDC1Q6X4U4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOSTDC1Q6X4U4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOSTDC1Q6X4U4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOSTDC1Q6X4U4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOSTDC1Q6X4U4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOSTDC1Q6X4U4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOSTDC1Q6X4U4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOSTDC1Q6X4U4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOSTDC1Q6X4U4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOSTDC1Q6X4U4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOSTDC1Q6X4U4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOSTDC1Q6X4U4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOSTDC1Q6X4U4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOSTDC1Q6X4U4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOSTDC1Q6X4U4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SOSTDC1Q6X4U4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SOSTDC1Q6X4U4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOSTDC1Q6X4U4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SOSTDC1Q6X4U4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOSTDC1Q6X4U4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SOSTDC1Q6X4U4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOSTDC1Q6X4U4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SOSTDC1Q6X4U4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOSTDC1Q6X4U4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOSTDC1Q6X4U4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOSTDC1Q6X4U4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOSTDC1Q6X4U4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOSTDC1Q6X4U4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOSTDC1Q6X4U4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOSTDC1Q6X4U4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOSTDC1Q6X4U4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOSTDC1Q6X4U4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOSTDC1Q6X4U4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOSTDC1Q6X4U4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOSTDC1Q6X4U4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOSTDC1Q6X4U4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOSTDC1Q6X4U4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOSTDC1Q6X4U4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOSTDC1Q6X4U4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOSTDC1Q6X4U4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOSTDC1Q6X4U4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SOSTDC1Q6X4U4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms