Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIF2

SYCE2, Synaptonemal complex central element protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE2Q6PIF2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCE2Q6PIF2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCE2Q6PIF2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCE2Q6PIF2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCE2Q6PIF2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCE2Q6PIF2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCE2Q6PIF2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCE2Q6PIF2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCE2Q6PIF2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCE2Q6PIF2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYCE2Q6PIF2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYCE2Q6PIF2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYCE2Q6PIF2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYCE2Q6PIF2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYCE2Q6PIF2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYCE2Q6PIF2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYCE2Q6PIF2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYCE2Q6PIF2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCE2Q6PIF2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCE2Q6PIF2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCE2Q6PIF2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCE2Q6PIF2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCE2Q6PIF2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCE2Q6PIF2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCE2Q6PIF2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCE2Q6PIF2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCE2Q6PIF2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCE2Q6PIF2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCE2Q6PIF2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCE2Q6PIF2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCE2Q6PIF2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCE2Q6PIF2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCE2Q6PIF2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCE2Q6PIF2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCE2Q6PIF2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCE2Q6PIF2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCE2Q6PIF2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCE2Q6PIF2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCE2Q6PIF2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCE2Q6PIF2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCE2Q6PIF2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCE2Q6PIF2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCE2Q6PIF2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCE2Q6PIF2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCE2Q6PIF2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCE2Q6PIF2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCE2Q6PIF2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SYCE2Q6PIF2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SYCE2Q6PIF2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SYCE2Q6PIF2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYCE2Q6PIF2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYCE2Q6PIF2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYCE2Q6PIF2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYCE2Q6PIF2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYCE2Q6PIF2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYCE2Q6PIF2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCE2Q6PIF2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCE2Q6PIF2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCE2Q6PIF2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCE2Q6PIF2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCE2Q6PIF2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCE2Q6PIF2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCE2Q6PIF2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCE2Q6PIF2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCE2Q6PIF2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCE2Q6PIF2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCE2Q6PIF2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCE2Q6PIF2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCE2Q6PIF2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCE2Q6PIF2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCE2Q6PIF2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCE2Q6PIF2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCE2Q6PIF2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCE2Q6PIF2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYCE2Q6PIF2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYCE2Q6PIF2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYCE2Q6PIF2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYCE2Q6PIF2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYCE2Q6PIF2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYCE2Q6PIF2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYCE2Q6PIF2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYCE2Q6PIF2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYCE2Q6PIF2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYCE2Q6PIF2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYCE2Q6PIF2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYCE2Q6PIF2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYCE2Q6PIF2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCE2Q6PIF2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCE2Q6PIF2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYCE2Q6PIF2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYCE2Q6PIF2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYCE2Q6PIF2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCE2Q6PIF2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCE2Q6PIF2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCE2Q6PIF2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCE2Q6PIF2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCE2Q6PIF2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCE2Q6PIF2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCE2Q6PIF2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCE2Q6PIF2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms