Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE9

LCN8, Epididymal-specific lipocalin-8, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN8Q6JVE9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCN8Q6JVE9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCN8Q6JVE9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCN8Q6JVE9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCN8Q6JVE9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCN8Q6JVE9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCN8Q6JVE9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCN8Q6JVE9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCN8Q6JVE9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCN8Q6JVE9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCN8Q6JVE9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCN8Q6JVE9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCN8Q6JVE9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCN8Q6JVE9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCN8Q6JVE9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCN8Q6JVE9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCN8Q6JVE9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCN8Q6JVE9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCN8Q6JVE9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCN8Q6JVE9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCN8Q6JVE9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCN8Q6JVE9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCN8Q6JVE9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LCN8Q6JVE9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCN8Q6JVE9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCN8Q6JVE9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCN8Q6JVE9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCN8Q6JVE9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCN8Q6JVE9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LCN8Q6JVE9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCN8Q6JVE9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCN8Q6JVE9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCN8Q6JVE9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCN8Q6JVE9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCN8Q6JVE9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LCN8Q6JVE9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCN8Q6JVE9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCN8Q6JVE9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCN8Q6JVE9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCN8Q6JVE9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCN8Q6JVE9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCN8Q6JVE9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCN8Q6JVE9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCN8Q6JVE9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCN8Q6JVE9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCN8Q6JVE9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LCN8Q6JVE9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCN8Q6JVE9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCN8Q6JVE9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCN8Q6JVE9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCN8Q6JVE9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCN8Q6JVE9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCN8Q6JVE9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCN8Q6JVE9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCN8Q6JVE9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCN8Q6JVE9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCN8Q6JVE9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCN8Q6JVE9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCN8Q6JVE9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCN8Q6JVE9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCN8Q6JVE9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCN8Q6JVE9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LCN8Q6JVE9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCN8Q6JVE9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCN8Q6JVE9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCN8Q6JVE9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCN8Q6JVE9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCN8Q6JVE9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCN8Q6JVE9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCN8Q6JVE9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCN8Q6JVE9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCN8Q6JVE9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCN8Q6JVE9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCN8Q6JVE9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCN8Q6JVE9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCN8Q6JVE9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCN8Q6JVE9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCN8Q6JVE9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCN8Q6JVE9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCN8Q6JVE9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCN8Q6JVE9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCN8Q6JVE9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCN8Q6JVE9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCN8Q6JVE9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCN8Q6JVE9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCN8Q6JVE9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCN8Q6JVE9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCN8Q6JVE9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCN8Q6JVE9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCN8Q6JVE9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCN8Q6JVE9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCN8Q6JVE9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCN8Q6JVE9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCN8Q6JVE9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCN8Q6JVE9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCN8Q6JVE9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCN8Q6JVE9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCN8Q6JVE9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCN8Q6JVE9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCN8Q6JVE9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms