Protein–RNA interactions for Protein: Q6EKJ0

GTF2IRD2B, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2IRD2BQ6EKJ0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2IRD2BQ6EKJ0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2IRD2BQ6EKJ0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2IRD2BQ6EKJ0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2IRD2BQ6EKJ0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GTF2IRD2BQ6EKJ0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IRD2BQ6EKJ0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2IRD2BQ6EKJ0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IRD2BQ6EKJ0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IRD2BQ6EKJ0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IRD2BQ6EKJ0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IRD2BQ6EKJ0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IRD2BQ6EKJ0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IRD2BQ6EKJ0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IRD2BQ6EKJ0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IRD2BQ6EKJ0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2IRD2BQ6EKJ0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2IRD2BQ6EKJ0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2IRD2BQ6EKJ0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2IRD2BQ6EKJ0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2IRD2BQ6EKJ0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2IRD2BQ6EKJ0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2IRD2BQ6EKJ0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2IRD2BQ6EKJ0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2IRD2BQ6EKJ0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2IRD2BQ6EKJ0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2IRD2BQ6EKJ0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2IRD2BQ6EKJ0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2IRD2BQ6EKJ0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2IRD2BQ6EKJ0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2IRD2BQ6EKJ0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms