Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZY7

SCARA3, Scavenger receptor class A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA3Q6AZY7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCARA3Q6AZY7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCARA3Q6AZY7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCARA3Q6AZY7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCARA3Q6AZY7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCARA3Q6AZY7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCARA3Q6AZY7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCARA3Q6AZY7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCARA3Q6AZY7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCARA3Q6AZY7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCARA3Q6AZY7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCARA3Q6AZY7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCARA3Q6AZY7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCARA3Q6AZY7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCARA3Q6AZY7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCARA3Q6AZY7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SCARA3Q6AZY7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCARA3Q6AZY7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCARA3Q6AZY7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCARA3Q6AZY7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCARA3Q6AZY7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SCARA3Q6AZY7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCARA3Q6AZY7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCARA3Q6AZY7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCARA3Q6AZY7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCARA3Q6AZY7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SCARA3Q6AZY7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCARA3Q6AZY7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCARA3Q6AZY7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCARA3Q6AZY7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCARA3Q6AZY7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCARA3Q6AZY7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCARA3Q6AZY7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SCARA3Q6AZY7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCARA3Q6AZY7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCARA3Q6AZY7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SCARA3Q6AZY7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCARA3Q6AZY7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCARA3Q6AZY7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCARA3Q6AZY7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCARA3Q6AZY7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCARA3Q6AZY7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCARA3Q6AZY7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SCARA3Q6AZY7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SCARA3Q6AZY7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCARA3Q6AZY7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SCARA3Q6AZY7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCARA3Q6AZY7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCARA3Q6AZY7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCARA3Q6AZY7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCARA3Q6AZY7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCARA3Q6AZY7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCARA3Q6AZY7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCARA3Q6AZY7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCARA3Q6AZY7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCARA3Q6AZY7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SCARA3Q6AZY7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCARA3Q6AZY7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCARA3Q6AZY7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCARA3Q6AZY7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCARA3Q6AZY7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCARA3Q6AZY7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCARA3Q6AZY7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCARA3Q6AZY7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCARA3Q6AZY7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SCARA3Q6AZY7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCARA3Q6AZY7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCARA3Q6AZY7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCARA3Q6AZY7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCARA3Q6AZY7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCARA3Q6AZY7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCARA3Q6AZY7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCARA3Q6AZY7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCARA3Q6AZY7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCARA3Q6AZY7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCARA3Q6AZY7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCARA3Q6AZY7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCARA3Q6AZY7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCARA3Q6AZY7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCARA3Q6AZY7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCARA3Q6AZY7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCARA3Q6AZY7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCARA3Q6AZY7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCARA3Q6AZY7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCARA3Q6AZY7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCARA3Q6AZY7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCARA3Q6AZY7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCARA3Q6AZY7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SCARA3Q6AZY7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCARA3Q6AZY7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCARA3Q6AZY7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCARA3Q6AZY7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCARA3Q6AZY7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCARA3Q6AZY7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCARA3Q6AZY7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCARA3Q6AZY7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCARA3Q6AZY7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCARA3Q6AZY7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SCARA3Q6AZY7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCARA3Q6AZY7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.9 ms