Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf135Q5VTT2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf135Q5VTT2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf135Q5VTT2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf135Q5VTT2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf135Q5VTT2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf135Q5VTT2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf135Q5VTT2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf135Q5VTT2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf135Q5VTT2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf135Q5VTT2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf135Q5VTT2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf135Q5VTT2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf135Q5VTT2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
C9orf135Q5VTT2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf135Q5VTT2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf135Q5VTT2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf135Q5VTT2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf135Q5VTT2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf135Q5VTT2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf135Q5VTT2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf135Q5VTT2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf135Q5VTT2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf135Q5VTT2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf135Q5VTT2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf135Q5VTT2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf135Q5VTT2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf135Q5VTT2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf135Q5VTT2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf135Q5VTT2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf135Q5VTT2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf135Q5VTT2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf135Q5VTT2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf135Q5VTT2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf135Q5VTT2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf135Q5VTT2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf135Q5VTT2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf135Q5VTT2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf135Q5VTT2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf135Q5VTT2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf135Q5VTT2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf135Q5VTT2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf135Q5VTT2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf135Q5VTT2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf135Q5VTT2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf135Q5VTT2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf135Q5VTT2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf135Q5VTT2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf135Q5VTT2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf135Q5VTT2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf135Q5VTT2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf135Q5VTT2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf135Q5VTT2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf135Q5VTT2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf135Q5VTT2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf135Q5VTT2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf135Q5VTT2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf135Q5VTT2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf135Q5VTT2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf135Q5VTT2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf135Q5VTT2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf135Q5VTT2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf135Q5VTT2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf135Q5VTT2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf135Q5VTT2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf135Q5VTT2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf135Q5VTT2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf135Q5VTT2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf135Q5VTT2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf135Q5VTT2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf135Q5VTT2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf135Q5VTT2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf135Q5VTT2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf135Q5VTT2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf135Q5VTT2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf135Q5VTT2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf135Q5VTT2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf135Q5VTT2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf135Q5VTT2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf135Q5VTT2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf135Q5VTT2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf135Q5VTT2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf135Q5VTT2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf135Q5VTT2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf135Q5VTT2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf135Q5VTT2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf135Q5VTT2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf135Q5VTT2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf135Q5VTT2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C9orf135Q5VTT2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf135Q5VTT2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf135Q5VTT2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf135Q5VTT2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf135Q5VTT2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf135Q5VTT2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf135Q5VTT2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf135Q5VTT2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf135Q5VTT2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf135Q5VTT2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf135Q5VTT2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms