Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2Q4

CCNYL2, Cyclin-Y-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNYL2Q5T2Q4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCNYL2Q5T2Q4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNYL2Q5T2Q4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNYL2Q5T2Q4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNYL2Q5T2Q4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNYL2Q5T2Q4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNYL2Q5T2Q4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNYL2Q5T2Q4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNYL2Q5T2Q4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNYL2Q5T2Q4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNYL2Q5T2Q4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNYL2Q5T2Q4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNYL2Q5T2Q4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNYL2Q5T2Q4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNYL2Q5T2Q4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNYL2Q5T2Q4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNYL2Q5T2Q4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNYL2Q5T2Q4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNYL2Q5T2Q4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNYL2Q5T2Q4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNYL2Q5T2Q4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNYL2Q5T2Q4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNYL2Q5T2Q4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNYL2Q5T2Q4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNYL2Q5T2Q4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNYL2Q5T2Q4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNYL2Q5T2Q4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNYL2Q5T2Q4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNYL2Q5T2Q4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNYL2Q5T2Q4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNYL2Q5T2Q4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNYL2Q5T2Q4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNYL2Q5T2Q4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNYL2Q5T2Q4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNYL2Q5T2Q4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCNYL2Q5T2Q4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNYL2Q5T2Q4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNYL2Q5T2Q4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNYL2Q5T2Q4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNYL2Q5T2Q4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNYL2Q5T2Q4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNYL2Q5T2Q4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNYL2Q5T2Q4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNYL2Q5T2Q4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNYL2Q5T2Q4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNYL2Q5T2Q4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNYL2Q5T2Q4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNYL2Q5T2Q4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNYL2Q5T2Q4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNYL2Q5T2Q4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNYL2Q5T2Q4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNYL2Q5T2Q4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNYL2Q5T2Q4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNYL2Q5T2Q4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNYL2Q5T2Q4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNYL2Q5T2Q4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNYL2Q5T2Q4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNYL2Q5T2Q4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNYL2Q5T2Q4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNYL2Q5T2Q4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNYL2Q5T2Q4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNYL2Q5T2Q4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNYL2Q5T2Q4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNYL2Q5T2Q4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNYL2Q5T2Q4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNYL2Q5T2Q4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNYL2Q5T2Q4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNYL2Q5T2Q4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNYL2Q5T2Q4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNYL2Q5T2Q4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNYL2Q5T2Q4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNYL2Q5T2Q4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNYL2Q5T2Q4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNYL2Q5T2Q4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNYL2Q5T2Q4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNYL2Q5T2Q4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNYL2Q5T2Q4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNYL2Q5T2Q4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNYL2Q5T2Q4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNYL2Q5T2Q4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNYL2Q5T2Q4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNYL2Q5T2Q4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNYL2Q5T2Q4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNYL2Q5T2Q4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNYL2Q5T2Q4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNYL2Q5T2Q4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNYL2Q5T2Q4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNYL2Q5T2Q4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNYL2Q5T2Q4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNYL2Q5T2Q4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNYL2Q5T2Q4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNYL2Q5T2Q4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNYL2Q5T2Q4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNYL2Q5T2Q4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNYL2Q5T2Q4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNYL2Q5T2Q4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNYL2Q5T2Q4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNYL2Q5T2Q4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNYL2Q5T2Q4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNYL2Q5T2Q4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms