Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CC2D1BQ5T0F9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CC2D1BQ5T0F9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CC2D1BQ5T0F9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
CC2D1BQ5T0F9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CC2D1BQ5T0F9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CC2D1BQ5T0F9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CC2D1BQ5T0F9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CC2D1BQ5T0F9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CC2D1BQ5T0F9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CC2D1BQ5T0F9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
CC2D1BQ5T0F9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CC2D1BQ5T0F9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CC2D1BQ5T0F9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CC2D1BQ5T0F9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CC2D1BQ5T0F9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CC2D1BQ5T0F9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CC2D1BQ5T0F9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CC2D1BQ5T0F9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
CC2D1BQ5T0F9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CC2D1BQ5T0F9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CC2D1BQ5T0F9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CC2D1BQ5T0F9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CC2D1BQ5T0F9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CC2D1BQ5T0F9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CC2D1BQ5T0F9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CC2D1BQ5T0F9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CC2D1BQ5T0F9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CC2D1BQ5T0F9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CC2D1BQ5T0F9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CC2D1BQ5T0F9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CC2D1BQ5T0F9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CC2D1BQ5T0F9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CC2D1BQ5T0F9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CC2D1BQ5T0F9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CC2D1BQ5T0F9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CC2D1BQ5T0F9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CC2D1BQ5T0F9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CC2D1BQ5T0F9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CC2D1BQ5T0F9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CC2D1BQ5T0F9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
CC2D1BQ5T0F9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CC2D1BQ5T0F9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CC2D1BQ5T0F9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CC2D1BQ5T0F9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CC2D1BQ5T0F9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CC2D1BQ5T0F9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CC2D1BQ5T0F9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CC2D1BQ5T0F9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CC2D1BQ5T0F9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CC2D1BQ5T0F9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CC2D1BQ5T0F9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
CC2D1BQ5T0F9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CC2D1BQ5T0F9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CC2D1BQ5T0F9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CC2D1BQ5T0F9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CC2D1BQ5T0F9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
CC2D1BQ5T0F9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
CC2D1BQ5T0F9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CC2D1BQ5T0F9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CC2D1BQ5T0F9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CC2D1BQ5T0F9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CC2D1BQ5T0F9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CC2D1BQ5T0F9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CC2D1BQ5T0F9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
CC2D1BQ5T0F9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CC2D1BQ5T0F9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CC2D1BQ5T0F9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CC2D1BQ5T0F9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CC2D1BQ5T0F9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CC2D1BQ5T0F9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CC2D1BQ5T0F9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
CC2D1BQ5T0F9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CC2D1BQ5T0F9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CC2D1BQ5T0F9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CC2D1BQ5T0F9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CC2D1BQ5T0F9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CC2D1BQ5T0F9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CC2D1BQ5T0F9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CC2D1BQ5T0F9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CC2D1BQ5T0F9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CC2D1BQ5T0F9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CC2D1BQ5T0F9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CC2D1BQ5T0F9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CC2D1BQ5T0F9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CC2D1BQ5T0F9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CC2D1BQ5T0F9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CC2D1BQ5T0F9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CC2D1BQ5T0F9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CC2D1BQ5T0F9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CC2D1BQ5T0F9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CC2D1BQ5T0F9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CC2D1BQ5T0F9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CC2D1BQ5T0F9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CC2D1BQ5T0F9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CC2D1BQ5T0F9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CC2D1BQ5T0F9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CC2D1BQ5T0F9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CC2D1BQ5T0F9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CC2D1BQ5T0F9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms