Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD1

TIMM23B, Putative mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim23B, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM23BQ5SRD1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TIMM23BQ5SRD1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TIMM23BQ5SRD1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIMM23BQ5SRD1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TIMM23BQ5SRD1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TIMM23BQ5SRD1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TIMM23BQ5SRD1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMM23BQ5SRD1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMM23BQ5SRD1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMM23BQ5SRD1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMM23BQ5SRD1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMM23BQ5SRD1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMM23BQ5SRD1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMM23BQ5SRD1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMM23BQ5SRD1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMM23BQ5SRD1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMM23BQ5SRD1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMM23BQ5SRD1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMM23BQ5SRD1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMM23BQ5SRD1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TIMM23BQ5SRD1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TIMM23BQ5SRD1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TIMM23BQ5SRD1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TIMM23BQ5SRD1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TIMM23BQ5SRD1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TIMM23BQ5SRD1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMM23BQ5SRD1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMM23BQ5SRD1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMM23BQ5SRD1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMM23BQ5SRD1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMM23BQ5SRD1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMM23BQ5SRD1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMM23BQ5SRD1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMM23BQ5SRD1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMM23BQ5SRD1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMM23BQ5SRD1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMM23BQ5SRD1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMM23BQ5SRD1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMM23BQ5SRD1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMM23BQ5SRD1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMM23BQ5SRD1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMM23BQ5SRD1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMM23BQ5SRD1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMM23BQ5SRD1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMM23BQ5SRD1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMM23BQ5SRD1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMM23BQ5SRD1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMM23BQ5SRD1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMM23BQ5SRD1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TIMM23BQ5SRD1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TIMM23BQ5SRD1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TIMM23BQ5SRD1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TIMM23BQ5SRD1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TIMM23BQ5SRD1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TIMM23BQ5SRD1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TIMM23BQ5SRD1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TIMM23BQ5SRD1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TIMM23BQ5SRD1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TIMM23BQ5SRD1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TIMM23BQ5SRD1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TIMM23BQ5SRD1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TIMM23BQ5SRD1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TIMM23BQ5SRD1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TIMM23BQ5SRD1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TIMM23BQ5SRD1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TIMM23BQ5SRD1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TIMM23BQ5SRD1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TIMM23BQ5SRD1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TIMM23BQ5SRD1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TIMM23BQ5SRD1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TIMM23BQ5SRD1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TIMM23BQ5SRD1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TIMM23BQ5SRD1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TIMM23BQ5SRD1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TIMM23BQ5SRD1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TIMM23BQ5SRD1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TIMM23BQ5SRD1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TIMM23BQ5SRD1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TIMM23BQ5SRD1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TIMM23BQ5SRD1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TIMM23BQ5SRD1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TIMM23BQ5SRD1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TIMM23BQ5SRD1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TIMM23BQ5SRD1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TIMM23BQ5SRD1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TIMM23BQ5SRD1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TIMM23BQ5SRD1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TIMM23BQ5SRD1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TIMM23BQ5SRD1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TIMM23BQ5SRD1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TIMM23BQ5SRD1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TIMM23BQ5SRD1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TIMM23BQ5SRD1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TIMM23BQ5SRD1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TIMM23BQ5SRD1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TIMM23BQ5SRD1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TIMM23BQ5SRD1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TIMM23BQ5SRD1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TIMM23BQ5SRD1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TIMM23BQ5SRD1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms