Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ODF2Q5BJF6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ODF2Q5BJF6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ODF2Q5BJF6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ODF2Q5BJF6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ODF2Q5BJF6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ODF2Q5BJF6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ODF2Q5BJF6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ODF2Q5BJF6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ODF2Q5BJF6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ODF2Q5BJF6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ODF2Q5BJF6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ODF2Q5BJF6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ODF2Q5BJF6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ODF2Q5BJF6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ODF2Q5BJF6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ODF2Q5BJF6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ODF2Q5BJF6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ODF2Q5BJF6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ODF2Q5BJF6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ODF2Q5BJF6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ODF2Q5BJF6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ODF2Q5BJF6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ODF2Q5BJF6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ODF2Q5BJF6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ODF2Q5BJF6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ODF2Q5BJF6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ODF2Q5BJF6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ODF2Q5BJF6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ODF2Q5BJF6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ODF2Q5BJF6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ODF2Q5BJF6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ODF2Q5BJF6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ODF2Q5BJF6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ODF2Q5BJF6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ODF2Q5BJF6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ODF2Q5BJF6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ODF2Q5BJF6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ODF2Q5BJF6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ODF2Q5BJF6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ODF2Q5BJF6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ODF2Q5BJF6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ODF2Q5BJF6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ODF2Q5BJF6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ODF2Q5BJF6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ODF2Q5BJF6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ODF2Q5BJF6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ODF2Q5BJF6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ODF2Q5BJF6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ODF2Q5BJF6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ODF2Q5BJF6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ODF2Q5BJF6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ODF2Q5BJF6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ODF2Q5BJF6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ODF2Q5BJF6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ODF2Q5BJF6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ODF2Q5BJF6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ODF2Q5BJF6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ODF2Q5BJF6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ODF2Q5BJF6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ODF2Q5BJF6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ODF2Q5BJF6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ODF2Q5BJF6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ODF2Q5BJF6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ODF2Q5BJF6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ODF2Q5BJF6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ODF2Q5BJF6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ODF2Q5BJF6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ODF2Q5BJF6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ODF2Q5BJF6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ODF2Q5BJF6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ODF2Q5BJF6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ODF2Q5BJF6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ODF2Q5BJF6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ODF2Q5BJF6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ODF2Q5BJF6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ODF2Q5BJF6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ODF2Q5BJF6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ODF2Q5BJF6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ODF2Q5BJF6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ODF2Q5BJF6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ODF2Q5BJF6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ODF2Q5BJF6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ODF2Q5BJF6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ODF2Q5BJF6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ODF2Q5BJF6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ODF2Q5BJF6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ODF2Q5BJF6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ODF2Q5BJF6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ODF2Q5BJF6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ODF2Q5BJF6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ODF2Q5BJF6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ODF2Q5BJF6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ODF2Q5BJF6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ODF2Q5BJF6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ODF2Q5BJF6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ODF2Q5BJF6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ODF2Q5BJF6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ODF2Q5BJF6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ODF2Q5BJF6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms