Protein–RNA interactions for Protein: Q58FG1

HSP90AA4P, Putative heat shock protein HSP 90-alpha A4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AA4PQ58FG1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HSP90AA4PQ58FG1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HSP90AA4PQ58FG1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HSP90AA4PQ58FG1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
HSP90AA4PQ58FG1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HSP90AA4PQ58FG1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HSP90AA4PQ58FG1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HSP90AA4PQ58FG1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HSP90AA4PQ58FG1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HSP90AA4PQ58FG1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
HSP90AA4PQ58FG1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
HSP90AA4PQ58FG1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
HSP90AA4PQ58FG1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HSP90AA4PQ58FG1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HSP90AA4PQ58FG1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HSP90AA4PQ58FG1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HSP90AA4PQ58FG1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HSP90AA4PQ58FG1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HSP90AA4PQ58FG1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
HSP90AA4PQ58FG1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HSP90AA4PQ58FG1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HSP90AA4PQ58FG1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HSP90AA4PQ58FG1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HSP90AA4PQ58FG1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HSP90AA4PQ58FG1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HSP90AA4PQ58FG1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
HSP90AA4PQ58FG1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HSP90AA4PQ58FG1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
HSP90AA4PQ58FG1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HSP90AA4PQ58FG1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HSP90AA4PQ58FG1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HSP90AA4PQ58FG1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HSP90AA4PQ58FG1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HSP90AA4PQ58FG1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HSP90AA4PQ58FG1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HSP90AA4PQ58FG1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HSP90AA4PQ58FG1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HSP90AA4PQ58FG1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HSP90AA4PQ58FG1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HSP90AA4PQ58FG1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HSP90AA4PQ58FG1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HSP90AA4PQ58FG1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HSP90AA4PQ58FG1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HSP90AA4PQ58FG1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HSP90AA4PQ58FG1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HSP90AA4PQ58FG1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HSP90AA4PQ58FG1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HSP90AA4PQ58FG1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
HSP90AA4PQ58FG1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HSP90AA4PQ58FG1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
HSP90AA4PQ58FG1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HSP90AA4PQ58FG1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
HSP90AA4PQ58FG1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
HSP90AA4PQ58FG1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HSP90AA4PQ58FG1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HSP90AA4PQ58FG1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HSP90AA4PQ58FG1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HSP90AA4PQ58FG1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HSP90AA4PQ58FG1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HSP90AA4PQ58FG1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HSP90AA4PQ58FG1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
HSP90AA4PQ58FG1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HSP90AA4PQ58FG1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HSP90AA4PQ58FG1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HSP90AA4PQ58FG1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HSP90AA4PQ58FG1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HSP90AA4PQ58FG1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HSP90AA4PQ58FG1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HSP90AA4PQ58FG1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HSP90AA4PQ58FG1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HSP90AA4PQ58FG1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HSP90AA4PQ58FG1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HSP90AA4PQ58FG1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HSP90AA4PQ58FG1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HSP90AA4PQ58FG1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
HSP90AA4PQ58FG1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HSP90AA4PQ58FG1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HSP90AA4PQ58FG1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HSP90AA4PQ58FG1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HSP90AA4PQ58FG1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HSP90AA4PQ58FG1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HSP90AA4PQ58FG1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HSP90AA4PQ58FG1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HSP90AA4PQ58FG1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HSP90AA4PQ58FG1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HSP90AA4PQ58FG1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HSP90AA4PQ58FG1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HSP90AA4PQ58FG1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HSP90AA4PQ58FG1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HSP90AA4PQ58FG1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HSP90AA4PQ58FG1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HSP90AA4PQ58FG1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HSP90AA4PQ58FG1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HSP90AA4PQ58FG1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HSP90AA4PQ58FG1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HSP90AA4PQ58FG1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HSP90AA4PQ58FG1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms